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西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室)黄晶获国家专利权

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龙图腾网获悉西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室)申请的专利基于人工智能的共价型小分子药物设计模型的构建方法及构建装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118230852B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410441133.6,技术领域涉及:G16C20/50;该发明授权基于人工智能的共价型小分子药物设计模型的构建方法及构建装置是由黄晶;薛靖;陈金峰设计研发完成,并于2024-04-12向国家知识产权局提交的专利申请。

基于人工智能的共价型小分子药物设计模型的构建方法及构建装置在说明书摘要公布了:本申请提出了一种基于人工智能的共价型小分子药物设计模型的构建方法及构建装置,包括以下步骤:获取待结合靶蛋白以及与待结合靶蛋白对应的反应分子片段集合;利用反应分子片段集合反向约束训练第一小分子药物生成模型得到第二小分子药物生成模型;根据成药性规则制定成药性条件,基于成药性条件反向约束训练第二小分子药物生成模型得到第三小分子药物生成模型;基于综合打分平台对第三小分子药物生成模型生成的三级小分子结构表达式的综合得分信息反向约束训练第三小分子药物生成模型得到共价型小分子药物生成模型。本方案通过强化学习框架来生成大量高质量的共价型小分子,并通过引入MMGBSA计算来提高对共价型小分子结合能力的预测质量。

本发明授权基于人工智能的共价型小分子药物设计模型的构建方法及构建装置在权利要求书中公布了:1.一种基于人工智能的共价型小分子药物设计模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:获取待结合靶蛋白以及与待结合靶蛋白对应的反应分子片段集合,其中所述反应分子片段集合中设有至少一可与待结合靶蛋白中的共价反应位点反应的反应分子片段;利用反应分子片段集合反向约束训练第一小分子药物生成模型得到第二小分子药物生成模型,其中第一小分子药物生成模型被预训练以生成正确的小分子结构表达式,第二小分子药物生成模型被训练以生成被反应分子片段约束的小分子结构表达式;根据成药性规则制定成药性条件,基于成药性条件反向约束训练第二小分子药物生成模型得到第三小分子药物生成模型,其中第三小分子药物生成模型被训练以生成满足成药性条件的小分子结构表达式;基于综合打分平台对第三小分子药物生成模型生成的三级小分子结构表达式的综合得分信息反向约束训练第三小分子药物生成模型得到共价型小分子药物生成模型,其中综合打分平台包括基于三级小分子结构表达式生成优化分子文件的控制层和基于优化分子文件计算综合得分信息的执行层,所述控制层获取第一数量的三级小分子结构表达式组成小分子结构表达式集合,去除小分子结构表达式集合中无意义的三级小分子结构表达式得到优化小分子结构表达式集合,将所述优化小分子结构表达式集合中的每一三级小分子结构表达式转化为分子文件,并基于每一分子文件的分子构象获取每一分子文件的能量,对每一分子文件的分子构象进行调整使每一分子文件的能量最小得到优化分子组成优化分子文件集合,所述执行层计算每一优化分子文件与所述待结合靶蛋白的对接得分,并通过MMGBSA程序计算每一优化分子文件与待结合靶蛋白的结合能,对每一优化分子文件的与所述待结合靶蛋白的对接得分和结合能进行加权平均得到每一优化分子文件的综合得分信息。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室),其通讯地址为:310024 浙江省杭州市西湖区云栖小镇石龙山街18号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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