杭州电子科技大学应南娇获国家专利权
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龙图腾网获悉杭州电子科技大学申请的专利一种基于全基因组数据检测可移动遗传元件的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114595234B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202111663118.9,技术领域涉及:G06F16/23;该发明授权一种基于全基因组数据检测可移动遗传元件的方法是由应南娇;邵梦洁;李姗珊;马楠;侯吉丹设计研发完成,并于2021-12-31向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于全基因组数据检测可移动遗传元件的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于全基因组数据检测可移动遗传元件的方法,利用MGE特征序列提取算法获取可移动遗传元件特征序列,并通过blast工具得到可移动遗传元件预测集和结果集,采用全基因组测序技术对未知基因组序列的细菌进行个体分析测定完整的基因序列信息,有效解决了可移动遗传元件数据库无法及时更新,导致无法检查出全部的可移动遗传元件的问题,进一步提高了可移动元件的检出率,并为可移动遗传元件数据库的命名提供统一的格式,防止同样的可移动遗传元件误认成不同可移动遗传元件。
本发明授权一种基于全基因组数据检测可移动遗传元件的方法在权利要求书中公布了:1.一种基于全基因组数据检测可移动遗传元件的方法,其特征在于,包括下列步骤: S1获取细菌菌株的全基因组序列和可移动遗传元件数据库; S2通过MGE特征序列提取算法获取可移动遗传元件特征序列集,所述可移动遗传元件特征序列集包括插入序列末端反向重复序列集、整合酶的基因序列集、整合酶附着位点序列集和转座子正向重复序列集; S3通过BM字符串匹配算法以及blast工具将可移动遗传元件特征序列集与全基因组序列进行比对得到该序列中可移动遗传元件序列集; S4将可移动遗传元件序列集与可移动遗传元件数据库通过blast工具比对得到可移动遗传元件的预测集和结果集; S5输出可移动遗传元件的预测集和结果集。
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