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中国海洋大学汪岷获国家专利权

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龙图腾网获悉中国海洋大学申请的专利一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119007815B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-15发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411206536.9,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用是由汪岷;杨阳;何海峰;陶乐;王传超设计研发完成,并于2024-08-30向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用,属于基因检测技术领域。本发明包括序列数据的预处理、比对、注释和功能分析等步骤,通过对古代宏基因组片段进行高效、准确的数据处理和分析,能够揭示古代生物群体的遗传信息及其演化历史,为考古学、遗传学和环境科学等领域提供重要的数据支持和技术指导。本发明不仅能够克服传统方法的局限性,适应不同类型的古代样本,还能提供更全面的遗传信息,推动古代宏基因组研究的深入发展。通过新方法的开发和应用,研究人员将能够更准确地解析古代微生物群落的结构和功能。

本发明授权一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤: (1)样本采集与处理:从古代生物遗骸中提取样本并进行预处理,并进行双端150bp建库测序; (2)序列数据的预处理:首先使用质量控制软件进行数据校正,挑选测序数据中的DNA片段,使用双端合并软件对经过挑选的测序数据进行双端合并,取能够成功合并的片段进行后续分析;所述步骤(2)具体包括: 1)数据校正:使用质量控制软件如kneaddata或trimmomatic除测序数据中的低质量序列和适配子污染,确保数据的纯净度和可靠性; 2)读长过滤:挑选测序数据中的DNA片段,使其不超过150bp,保证数据来源的纯净,使用fastqc或seqkit工具; 3)现代污染去除:使用双端合并软件如flash或pandaseq对经过挑选的测序数据进行双端合并,取能够成功合并的片段进行后续分析; (3)序列比对:使用DNA片段进行拼接为重叠群contig,使用contig作为参考与目标DNA片段进行对比; (4)损伤评估:使用古代DNA评估软件进行估目标片段与重叠群的对比度,挑选鉴定目标DNA片段的损伤片段,标记目标DNA片段的损伤率; (5)古代DNA挑选:根据不同年代的损伤率,挑选不同损伤率的片段为古代DNA。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国海洋大学,其通讯地址为:266100 山东省青岛市崂山区松岭路238号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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