百图生科(北京)智能技术有限公司郭玉成获国家专利权
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龙图腾网获悉百图生科(北京)智能技术有限公司申请的专利一种多模态蛋白质设计方法、装置、系统及其存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119943206B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-22发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510413097.7,技术领域涉及:G16C20/50;该发明授权一种多模态蛋白质设计方法、装置、系统及其存储介质是由郭玉成;杨其荣;杨钰洁设计研发完成,并于2025-04-03向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种多模态蛋白质设计方法、装置、系统及其存储介质在说明书摘要公布了:本申请提供一种多模态蛋白质设计方法、装置、系统及其存储介质,涉及蛋白质设计和机器学习技术领域。所述多模态蛋白质设计方法包括:获取目标蛋白质的原始序列信息;根据原始序列信息确定目标蛋白质的可突变候选区域;基于可突变候选区域和所述原始序列信息利用零样本打分模型得到候选蛋白质序列推荐集;对候选蛋白质序列推荐集根据零样本打分模型进行聚类降维处理并根据隐空间表征进行采样筛选得到目标突变体蛋白序列。本申请所提供的多模态蛋白质设计方法在高效性、多目标优化能力、小样本适应性、泛化能力、优化效率、灵活性和可扩展性等方面展现出显著优势,能够广泛应用于生物医学、工业催化、材料科学等领域的蛋白质设计与优化。
本发明授权一种多模态蛋白质设计方法、装置、系统及其存储介质在权利要求书中公布了:1.一种多模态蛋白质设计方法,其特征在于,包括: 获取目标蛋白质的原始序列信息;其中,所述原始序列信息包括氨基酸序列和所述氨基酸序列对应的PDB结构信息; 根据所述原始序列信息,确定所述目标蛋白质的可突变候选区域; 在所述可突变候选区域内基于所述原始序列信息进行突变,生成不同的突变序列,得到突变序列库; 利用零样本打分模型对所述突变序列库中的每个突变序列进行评价,得到每个打分算法对应的打分评价结果,并且对所有所述打分评价结果整合得到综合评价结果;其中,所述零样本打分模型中包括不同目标属性的打分算法,包括蛋白质序列自然度算法、蛋白质结构自然度算法、蛋白质稳定性算法、蛋白质亲和力算法和功能活性算法中的至少一个;所述打分评价结果中包括序列自然度、序列合理性、结构自然度、结构稳定性、蛋白亲和力、功能活性和突变合理性中的至少一个; 基于所述综合评价结果,利用多目标优化算法对每个所述突变序列进行优化,得到优化后的候选蛋白质序列推荐集; 获取基于所述综合评价结果的所述突变序列库中突变序列的验证实验的实验数据; 构建多模态目标属性打分模型,并利用所述实验数据训练所述多模态目标属性打分模型; 基于所述验证实验对所述多模态目标属性打分模型进行迭代优化,得到更新后的所述多模态目标属性打分模型,并基于更新后的所述多模态目标属性打分模型得到优化后的候选蛋白质序列推荐集;其中,所述迭代优化,包括: 根据所述多模态目标属性打分模型和所述零样本打分模型对所述候选蛋白质序列推荐集进行评价,得到打分评价结果; 根据所述打分评价结果,筛选得到候选序列,构建候选序列集; 获取所述候选序列集中的每个候选序列对应的验证实验的实验数据,并利用所述实验数据更新所述多模态目标属性打分模型; 利用更新后的所述多模态目标属性打分模型和所述零样本打分模型,对所述候选蛋白质序列推荐集进行评价,得到新的打分评价结果; 利用新的所述打分评价结果筛选出目标序列,构建新的候选蛋白质序列推荐集,并获取所述新的候选蛋白质序列推荐集对应新的实验数据; 基于所述新的实验数据,对所述多模态目标属性打分模型的迭代优化进行评估,以便于完成所述迭代优化; 对所述候选蛋白质序列推荐集根据所述零样本打分模型进行聚类降维处理,并根据隐空间表征进行采样筛选,得到目标突变体蛋白序列。
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