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电子科技大学长三角研究院(衢州)李鸿飞获国家专利权

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龙图腾网获悉电子科技大学长三角研究院(衢州)申请的专利基于转录因子基序预测scATAC-seq中启动子片段的分类方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120032725B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510495859.2,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权基于转录因子基序预测scATAC-seq中启动子片段的分类方法是由李鸿飞;邹权;罗锡梅设计研发完成,并于2025-04-21向国家知识产权局提交的专利申请。

基于转录因子基序预测scATAC-seq中启动子片段的分类方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于转录因子基序预测scATAC‑seq中启动子片段的分类方法,它解决了现有技术中通过多组学整合来确定启动子的方式繁琐且效率低的问题。它包括通过分析同一组织中的多种组学数据,接着通过RNA表达量分析,筛选出前2000个高变基因。然后利用基因ID确定这些基因是否具有对应的RNA表达量,并找到这些基因的转录起始位点TSS处的scATAC‑seq序列,同时区分出非启动子区域的序列,并将启动子区域的序列分割成100bp的片段,以便进行后续的特征提取。随后利用motif特征对这些片段进行特征提取,建立预测模型,用于预测启动子区域。最后对预测模型进行评估,确保其具有良好的预测性能和准确性。本发明的优点在于:能够通过学习多组学数据可以准确快速的识别启动子区域。

本发明授权基于转录因子基序预测scATAC-seq中启动子片段的分类方法在权利要求书中公布了:1.基于转录因子基序预测scATAC-seq中启动子片段的分类方法,其特征在于,本方法包括以下步骤: S1、获取同一组织的多组学数据并进行比较,确保两个组学数据中的细胞数量一致; S2、通过RNA的基因表达水平数据确定前2000个高变基因; S3、将scATAC-seq数据与通过标识符确定RNA表达量对应的基因转录起始位点TSS进行对应,有对应则划分为启动子,无对应则划分为非启动子; S4、将启动子和非启动子数据分割为100bp的序列长度,并划分出训练集、测试集和独立集; S5、利用motif从序列中提取特征,构建特征矩阵; S6、基于提取的特征,使用CNN模型构建启动子的预测模型; S7、对建立的预测模型进行性能评估。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人电子科技大学长三角研究院(衢州),其通讯地址为:324003 浙江省衢州市柯城区成电路1号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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