青岛可立生物医药有限公司许可获国家专利权
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龙图腾网获悉青岛可立生物医药有限公司申请的专利一种专病组学数据库的构建方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118588169B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410636989.9,技术领域涉及:G16B35/10;该发明授权一种专病组学数据库的构建方法及系统是由许可;宋宏涛;李雨晨设计研发完成,并于2024-05-22向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种专病组学数据库的构建方法及系统在说明书摘要公布了:本申请涉及生物信息学领域,具体涉及一种专病组学数据库的构建方法及系统。包括获取一种疾病样本集的基因表达数据及基因ID;将所述基因表达数据映射到生物学通路层面得到通路数据及通路ID;将所述基因表达数据映射到免疫细胞层面得到免疫细胞数据及免疫细胞ID;将所述通路ID、所述免疫细胞ID与基因ID进行关联得到关联关系;将所述关联关系、基因表达数据、通路数据、免疫细胞数据进行存储得到专病组学数据库。该方法构建的数据库包含基因、通路、免疫细胞的数据,能够同时得到某一疾病在多个维度的数据,具有很好临床价值。
本发明授权一种专病组学数据库的构建方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种专病组学数据库的构建方法,其特征在于,所述方法包括: 获取一种疾病样本集的基因表达数据及基因ID; 将所述基因表达数据映射到生物学通路层面得到通路数据及通路ID;所述映射到生物学通路层面是通过将基因表达数据转换为基因集,对所述基因集中基因进行富集差异评分,再对所述评分排序得到高表达水平通路; 将所述基因表达数据映射到免疫细胞层面得到免疫细胞数据及免疫细胞ID;所述映射到免疫细胞层面为:对基因表达数据进行线性支持向量回归分析,计算样本中各细胞类型的相对丰度,将所述细胞类型的相对丰度与细胞类型特有的基因表达库的数据进行比较计算得到每种细胞类型的估计比例; 将所述通路ID、所述免疫细胞ID与基因ID进行关联得到关联关系;将基因ID对应的通路ID、免疫细胞ID关联在一张数据表中,通过检索ID数据表查询得到基因ID对应的其他ID,再基于其他ID查询得到相关数据内容; 将所述关联关系、基因表达数据、通路数据、免疫细胞数据进行存储得到专病组学数据库;在数据库中通过ID数据表查询得到基因、通路、免疫细胞的三维数据内容; 所述转换的方法为GSVA、GSEA; 所述基因表达数据为GO数据集、KEGG数据集; 所述映射到免疫细胞的方法为:cibersort; 所述细胞类型特有的基因表达库为LM22数据集。
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