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广州市碳码科技有限责任公司方志远获国家专利权

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龙图腾网获悉广州市碳码科技有限责任公司申请的专利一种barcode微滴的单细胞测序方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115058503B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210729616.7,技术领域涉及:C12Q1/6869;该发明授权一种barcode微滴的单细胞测序方法是由方志远;陈国强;罗微;周丹;邓裕华;杜岗设计研发完成,并于2022-06-24向国家知识产权局提交的专利申请。

一种barcode微滴的单细胞测序方法在说明书摘要公布了:本发明属于单细胞测序方法的技术领域,具体涉及一种barcode微滴的单细胞测序方法,其为基于纳米和微米尺寸的barcode微滴用于单细胞及亚细胞结构的单细胞测序,适合于全长mRNA测序及随机引物法mRNA测序。

本发明授权一种barcode微滴的单细胞测序方法在权利要求书中公布了:1.一种barcode微滴的单细胞测序方法,其特征在于,包括如下步骤: 1)barcode微滴制备及特征 1.1)建立barcode微滴 将barcode微滴分为多个大的液滴库进行建库,利用微流控芯片系统分离微滴,包括barcode库1、barcode库2、barcode库3,…,以此类推; 所述barcode库1包括100个细分,为barcode1-1,barcode1-2,....,barcode1-100; 所述barcode1-1制备出10n个液滴,其中n>1,每个液滴含有不低于106个barcode1-1,同理制备100个细分barcode“1-n”的液滴库barcode1-1-barcode1-100,并混合成为液滴库barcode库1,含有10n+2个液滴; 同理,制备其他barcode“N-n”液滴库N; 1.2)微滴制备分离时分别从混合库1以及其后的n个库中分别取1个液滴,n≥1,将取出的多个液滴与扩增mix混合形成一个扩增液滴; 扩增后最后对产物进行破乳,收集cDNA并进行建库,进行测序和分析; 2)对全长mRNA以及引物mRNA进行建库测序:将包含多个片段的Barcode用于标记细胞,以及一个与Barcode连接的UMI来标记转录本; 所述Barcode为3段序列组成,分别为上游Barcode、中间Barcode和下游Barcode; 所述上游Barcode的3’端为3-5个G,用于RACE反转录,5’端为adapter序列,用于连接测序接头; 上游Barcode的序列为:5'-adapter+jjjjjj+GGG-3’; 所述j为细胞标记核酸序列celllable; 所述中间Barcode的3’端为polyT序列,用于mRNA的反转录,5’端为linker; 中间Barcode的序列为:3'-polyT+jjjjjj+linker-5’; 所述j为celllable; 所述下游Barcode3’端为anti-linker,与上一个中间Barcode的linker互补,中间为celllable,5’端为UMI序列; 下游Barcode的序列为:5'-nnnnnnnnnnnnnn++jjjjjj+anti-linker-3’; 所述n为UMI; 所述UMI由4~10个核苷酸随机排列组成,在mRNA反转录后,进入到文库中,每一个mRNA随机连上一个UMI,因此可以计数不同的UMI,最终实现mRNA的计数; 3)利用转座酶法或者随机引物法扩增cDNA得到双链DNA文库,并采用Illumina高通量测序系统进行测序。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人广州市碳码科技有限责任公司,其通讯地址为:510000 广东省广州市广州高新技术产业开发区科学城南云二路62号自编一栋新华汇A楼二层201房;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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