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龙图腾网获悉中国医学科学院基础医学研究所申请的专利基于RNA-DNA和DNA-DNA互作信息的染色质互作信息增强方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120183510B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-05发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510656424.1，技术领域涉及：G16B40/00；该发明授权基于RNA-DNA和DNA-DNA互作信息的染色质互作信息增强方法是由陈阳;杨玉容;李铭鸿;李雪媛设计研发完成，并于2025-05-21向国家知识产权局提交的专利申请。

本基于RNA-DNA和DNA-DNA互作信息的染色质互作信息增强方法在说明书摘要公布了：本发明提供一种基于RNA‑DNA和DNA‑DNA互作信息的染色质互作信息增强方法，涉及生物信息学技术领域。所述方法包括：收集RNA‑DNA互作的iMARGI数据和DNA‑DNA互作的原始Hi‑C数据；对iMARGI数据进行特征提取后进行皮尔逊相关系数计算，得到融合RNA信息的DNA‑DNA特征相关系数矩阵；对原始Hi‑C数据下采样后进行FAN完整化处理，得到完整化的Hi‑C矩阵；构建CNN网络模型，以上述两部分为输入，对模型进行训练，模型的输出为增强后的Hi‑C矩阵；对于训练好的模型，输入不同RNA类型的数据，预测得到相应的Hi‑C矩阵，用于下游分析。本发明能够整合RNA互作数据与Hi‑C数据，实现多模态数据整合与分析，推动RNA与染色质相互作用研究的进一步发展。

本发明授权基于RNA-DNA和DNA-DNA互作信息的染色质互作信息增强方法在权利要求书中公布了：1.一种基于RNA-DNA和DNA-DNA互作信息的染色质互作信息增强方法，其特征在于，包括以下步骤： S1、收集相同细胞系的RNA-DNA互作的iMARGI数据和DNA-DNA互作的原始Hi-C数据； S2、对所述iMARGI数据进行特征提取后进行皮尔逊相关系数计算，得到全基因组的融合RNA信息的DNA-DNA特征相关系数矩阵；对所述原始Hi-C数据下采样后进行FAN完整化处理，得到完整化的Hi-C矩阵； 所述步骤S2具体包括： 对RNA-DNA互作数据进行特征提取，并对提取的特征进行皮尔逊相关系数计算，得到融合RNA信息的DNA-DNA特征相关系数矩阵； 对原始Hi-C数据进行KR归一化处理，采用125和1100下采样率对KR归一化处理后的Hi-C数据进行平滑处理，利用FAN方法对下采样后的Hi-C数据进行完整化处理，得到完整化的Hi-C矩阵； S3、构建CNN网络模型，以所述融合RNA信息的DNA-DNA特征相关系数矩阵和所述完整化的Hi-C矩阵作为模型的输入，对模型进行训练，模型的输出为增强后的Hi-C矩阵； 所述步骤S3中，对于完整化的Hi-C矩阵，使用两次DoubleConv模块加DownConv层进行下采样，两次DoubleConv模块加UpConv层进行上采样，最后经过一个DoubleConv模块得到第一结果；对于融合RNA信息的DNA-DNA特征相关系数矩阵，使用三次DoubleConv模块得到第二结果；将第一结果和第二结果进行合并操作后，再经过两次DoubleConv，得到最终增强后的Hi-C矩阵； S4、对于训练好的模型，输入不同RNA类型的数据，预测得到相应的Hi-C矩阵，用于下游分析。

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