曲阜师范大学尚军亮获国家专利权
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龙图腾网获悉曲阜师范大学申请的专利基于空间表达增强和高可信度指导的空间转录组学多视图聚类方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119943164B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510015448.9,技术领域涉及:G16B40/30;该发明授权基于空间表达增强和高可信度指导的空间转录组学多视图聚类方法是由尚军亮;张晓晗;孙燕;赵妍;秦宝娟;刘金星设计研发完成,并于2025-01-06向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于空间表达增强和高可信度指导的空间转录组学多视图聚类方法在说明书摘要公布了:本发明公开了基于空间表达增强和高可信度指导的空间转录组学多视图聚类方法,属于生物信息学技术领域,包括以下步骤:步骤1、设计多视图构建模块,构建出增强视图以充分学习基因表达结构的互补性信息;步骤2、基于协同嵌入,对基因表达数据进行重构;步骤3:通过权重共享的伪标签分类器对空间嵌入、特征嵌入、增强嵌入和协同嵌入进行聚类预测;步骤4:联合优化训练总损失函数,对优化的协同嵌入进行聚类,生成聚类标签。本发明采用上述的基于空间表达增强和高可信度指导的空间转录组学多视图聚类方法,在空间域识别、轨迹推断和癌症基因异质性方面性能良好,有利于帮助研究人员深入了解细胞生物学和疾病的发展过程。
本发明授权基于空间表达增强和高可信度指导的空间转录组学多视图聚类方法在权利要求书中公布了:1.基于空间表达增强和高可信度指导的空间转录组学多视图聚类方法,其特征在于:包括以下步骤: 步骤1、设计多视图构建模块,首先构建特征邻居矩阵、空间邻居矩阵,结合基因表达矩阵组建特征视图、空间视图,然后通过构建加权邻居矩阵并生成互补的增强基因表达矩阵,构建出增强视图以充分学习基因表达结构的互补性信息; 步骤2、组建多视图协同卷积网络框架,独立学习每个视图的嵌入表示,然后引入注意力机制整合各视图嵌入,生成一个更加全面且精确的协同嵌入,最后利用零膨胀负二项分布ZINB解码器,基于协同嵌入,对基因表达数据进行重构; 步骤3:设计高可信度聚类指导模块,通过权重共享的伪标签分类器对空间嵌入、特征嵌入、增强嵌入和协同嵌入进行聚类预测,利用高可信度的聚类结果作为指导,确保聚类过程的准确性和稳定性; 步骤4:联合优化训练总损失函数,对优化的协同嵌入进行聚类,生成聚类标签,用于空间域识别、可视化、轨迹推断的下游任务分析。
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