合肥综合性国家科学中心大健康研究院崔丰磊获国家专利权
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龙图腾网获悉合肥综合性国家科学中心大健康研究院申请的专利一种基于动态规划算法的mRNA序列优化方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119785885B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411993498.6,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种基于动态规划算法的mRNA序列优化方法是由崔丰磊;费才溢;徐实设计研发完成,并于2024-12-31向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于动态规划算法的mRNA序列优化方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于动态规划算法的mRNA序列优化方法,涉及mRNA序列优化领域。本发明分别考虑mRNA进入宿主细胞之后,mRNA翻译成蛋白质序列过程中,相关的正促进负阻碍两方面的因素,采用动态规划算法获得其最优的综合效应,极大提高mRNA最终的蛋白翻译产量,在mRNA疫苗领域具有良好的应用前景。
本发明授权一种基于动态规划算法的mRNA序列优化方法在权利要求书中公布了:1.一种mRNA序列优化方法,所述mRNA用于在目标物种或目标细胞中表达,其特征在于,所述方法包括步骤: S1提供所述目标物种或目标细胞的编码序列CDS中的密码子发生频率,根据密码子发生频率,获得用于替换的密码子集合; 其中,所述的密码子集合不包括稀有密码子,所述稀有密码子为目标物种或目标细胞CDS中每千个密码子中出现次数<10次的密码子; S2提供二碱基对RNA内切酶的敏感指数; S3基于步骤S1获得的密码子发生频率和步骤S2获得的二碱基对RNA内切酶的敏感指数,计算所述密码子集合中每个密码子的单个密码子评分; S4提供待优化的mRNA编码序列或其编码的氨基酸序列,针对所述序列中的每个氨基酸位点,从步骤S1所述的密码子集合中选出对应的所有同义密码子,并基于步骤S3得到的单个密码子评分和相邻密码子之间的连接赋值,利用状态转移方程计算各氨基酸位点上每个同义密码子对应的最大序列评分; S5基于步骤S4获得的每个同义密码子对应的最大序列评分,获得全长mRNA编码序列对应的最大序列评分,从而获得最优密码子组合,即为优化后的mRNA编码序列, 其中,所述最优密码子组合是使得全长mRNA编码序列评分最大化的密码子组合。
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