北京理工大学张永谦获国家专利权
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龙图腾网获悉北京理工大学申请的专利一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116779037B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310815532.X,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法是由张永谦;王旭;李诺敏设计研发完成,并于2023-07-04向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法,属于生物分析技术领域。所述方法首先对待鉴定抗体进行切割,得到的肽段溶液进行液相‑质谱分析;然后通过检索确定轻链、重链恒定区肽段序列,并通过从头测序确定可变区候选肽段序列;之后通过发展动态窗口方法结合物种特异性抗体同源库,对从头测序错误进行有效的识别,并能够区分同分异构体形式的亮氨酸与异亮氨酸,提升了组装准确率与组装稳定性。
本发明授权一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法在权利要求书中公布了:1.一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法,其特征在于:所述方法步骤包括: 1对待鉴定抗体进行氨基酸水平切割,得到肽段溶液; 2对得到的肽段溶液分别进行液相分离和质谱分析,得到质谱文件; 3对得到的质谱文件进行pFind检索,确定待鉴定抗体的轻链恒定区肽段序列和待鉴定抗体的重链恒定区肽段序列;对得到的质谱文件进行pNovo从头测序,确定待鉴定抗体的轻链、重链可变区候选肽段序列; 4分别对待鉴定抗体的轻链、重链恒定区肽段序列进行同源搜索,获得高同源的完整轻链和重链;分别统计完整轻链、重链中可变区每个位点的氨基酸组成进行统计,得到轻链可变区氨基酸概率分布表和重链可变区氨基酸概率分布表; 5从概率分布表中获得同源标签,从步骤3的待鉴定抗体的可变区候选肽段序列中筛选包含所述同源标签的肽段,得到高可信可变区肽段序列;所述同源标签由5~8个氨基酸组成序列组成,所述氨基酸序列中包含2个以上概率大于60%的氨基酸和3个概率在前5的氨基酸; 6将高可信可变区肽段序列分为多个长度K为5~8的小肽段序列,统计每个小肽段序列的出现次数及概率,得到每个小肽段的组装得分,以满足同源标签且得分最高的小肽段序列为组装起点,沿两端寻找满足具有K-1个重叠氨基酸的小肽段,根据组装得分在末端添加一个氨基酸,重复组装,得到轻链、重链可变区肽段序列; 7将步骤3中的轻链恒定区肽段序列、重链恒定区肽段序列分别与轻链可变区肽段序列、重链可变区肽段序列进行二次组装,得到完成的抗体轻链和重链。
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