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上海交通大学医学院何牮获国家专利权

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龙图腾网获悉上海交通大学医学院申请的专利基于分子对接的多层次虚拟筛选方法及其筛选的化合物在制备抗肺癌药物中的用途获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116312868B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310226625.9,技术领域涉及:G16C20/64;该发明授权基于分子对接的多层次虚拟筛选方法及其筛选的化合物在制备抗肺癌药物中的用途是由何牮;刘梓学设计研发完成,并于2023-03-08向国家知识产权局提交的专利申请。

基于分子对接的多层次虚拟筛选方法及其筛选的化合物在制备抗肺癌药物中的用途在说明书摘要公布了:本发明涉及一种基于分子对接的多层次虚拟筛选方法及其筛选的化合物在制备抗肺癌药物中的用途,通过分析第一次筛选得到的小分子化合物种类,选取人参皂苷类化合物作为第二次筛选库;再选定人参皂苷类化合物库作为第二次筛选配体,再次使用进行虚拟筛选,获得TMPRSS2与人参皂苷类化合物的对接得分结果,得到排名前五化合物,进行分子对接与活性研究。本发明通过多层次的虚拟筛选,自建二次虚拟筛选配体文库,丰富了该种类配体品种的同时,减小了配体库的化合物数量,在有效提升虚拟筛选精确率的同时,降低实验筛选化合物数量,缩短研发周期和节约成本。

本发明授权基于分子对接的多层次虚拟筛选方法及其筛选的化合物在制备抗肺癌药物中的用途在权利要求书中公布了:1.一种基于分子对接的多层次虚拟筛选方法,其特征在于,包括如下步骤: S1、确定TMPRSS2蛋白作为受体蛋白;下载小分子化合物作为天然化合物配体小分子,完成受体与配体的准备工作; S2、使用虚拟筛选软件从天然化合物配体小分子的库中,进行第一次虚拟筛选,得到具有抑制TMPRSS2活性的天然化合物配体小分子的对接打分数据; S3、根据S2中排名靠前的化合物种类自建虚拟筛选库,使用虚拟筛选软件进行第二次虚拟筛选,得到具有抑制TMPRSS2活性的人参皂苷类配体小分子的对接打分数据; S4、根据S3打分数据筛选多个排名靠前的人参皂苷类配体小分子,再与TMPRSS2蛋白进行分子对接,将对接结果进行组合形成复合物,根据对接结果筛选出对接效果最佳的构象,即得多层次虚拟筛选的小分子化合物; 步骤S2中,第一次虚拟筛选具体为:将TMPRSS2蛋白与共结晶配体萘莫司他直接发生作用的位点作为对接活性位点,根据活性位点确定中心坐标、对接球体半径;设置对接次数,得到对接结果,根据对接得分进行排序; 活性位点的中心坐标是TMPRSS2蛋白与萘莫司他的共结晶配体中活性位点的中心位点,具体为:利用TMPRSS2蛋白与萘莫司他小分子具有良好的对接效果,其作用位点位于A链的SER-436、GLY-439、ASP-440、SER-441、GLN-438、CYS-437、GLY-464和ASP-440;根据作用位点在原共结晶配体复合物中找到原配体的中心坐标参数,即为活性位点的中心坐标; 步骤S4中,分子对接具体为:设置与步骤S2中相同的活性位点中心坐标、对接球体半径,设计对接盒子,根据poses打分数值筛选出对接效果最佳的构象。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人上海交通大学医学院,其通讯地址为:200025 上海市黄浦区重庆南路280号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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