浙江科技大学杨佳瑶获国家专利权
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龙图腾网获悉浙江科技大学申请的专利一种用于磁珠—核酸分离后序列质量评估的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120260681B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-12发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510733137.6,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种用于磁珠—核酸分离后序列质量评估的方法是由杨佳瑶;王行行;卢宣羽;程逸菲;王宏鹏;黄俊设计研发完成,并于2025-06-04向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种用于磁珠—核酸分离后序列质量评估的方法在说明书摘要公布了:本发明涉及序列质量评估领域,尤其涉及一种用于磁珠—核酸分离后序列质量评估的方法。包括:对经过磁珠分离后生成的核酸样本进行测序,得到核酸序列集合及其对应的质量分数;对核酸序列集合进行预处理,得到预处理后的核酸序列集合,通过序列完整性评估算法计算得到核酸序列的完整性得分;并通过序列一致性评分算法计算得到序列一致性评分;通过综合核酸序列的完整性得分和一致性评分计算得到综合质量评分,并根据综合质量评分将核酸序列划分为不同的质量等级。解决了传统方法在识别序列中的污染与错误时,仅依赖质量评分阈值,而未能综合考虑序列的碱基分布均匀性和熵值的技术问题。
本发明授权一种用于磁珠—核酸分离后序列质量评估的方法在权利要求书中公布了:1.一种用于磁珠—核酸分离后序列质量评估的方法,其特征在于,包括以下步骤: S1.对经过磁珠分离后生成的核酸样本进行测序,得到核酸序列集合及其对应的质量分数;对核酸序列集合进行预处理,得到预处理后的核酸序列集合,基于预处理后的核酸序列集合,通过序列完整性评估算法计算得到核酸序列的完整性得分,具体公式为: , 其中,表示第个核酸序列的完整性得分;表示对核酸序列中碱基集合进行求和运算;表示第个核酸序列中碱基出现的频率;表示第个核酸序列的有效长度,;表示污染惩罚项,将污染比例与熵值结合,用幂指数的形式控制惩罚程度,即对低污染、高熵值核酸序列的惩罚较轻,对高污染、低熵值核酸序列的惩罚较强;表示第个核酸序列的碱基分布熵值,熵值通过计算核酸序列中碱基频率的不确定性,量化其分布均匀性,熵值越高,则核酸序列中碱基分布越均匀,反之,低熵值则说明碱基分布偏倚,计算公式为:;为核酸序列中未知碱基的数量;表示第个核酸序列中的碱基数; S2.基于预处理后的核酸序列集合及其对应的质量分数,通过序列一致性评分算法计算得到序列一致性评分,具体公式为: , 其中,表示第个核酸序列的一致性评分,用于衡量核酸序列中低质量区域的影响;表示惩罚因子,用于调节低质量区域对核酸序列一致性评分的影响;表示第个核酸序列中低质量区域的数量,低质量区域定义为连续至少3个碱基的质量分数低于质量分数阈值的片段;表示第个低质量区域的长度权重,定义为第个低质量区域长度与核酸序列有效长度的比值;表示第个低质量区域的平均质量评分; 通过综合核酸序列的完整性得分和一致性评分计算得到综合质量评分,并根据综合质量评分将核酸序列划分为不同的质量等级,所述综合质量评分的范围在到之间,综合质量评分越接近表示核酸序列质量越高,反之,综合质量评分越接近则表示核酸序列质量较差; 综合质量评分的计算公式为: , 其中,表示第个核酸序列的综合质量评分;表示所有核酸序列中完整性评分的最大值,用于标准化完整性得分。
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