东北林业大学赵旭东获国家专利权
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龙图腾网获悉东北林业大学申请的专利一种基于协同共表达网络的癌症预后生存分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119601086B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-12发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510034865.8,技术领域涉及:G16B25/20;该发明授权一种基于协同共表达网络的癌症预后生存分析方法是由赵旭东设计研发完成,并于2025-01-09向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于协同共表达网络的癌症预后生存分析方法在说明书摘要公布了:本发明是一种基于协同共表达网络的癌症预后生存分析方法。本发明涉及癌症肿瘤预后分析技术领域,本发明基于公开数据库,收集癌症的多组学数据,并对数据进行预处理;基于处理后的数据,构建面向癌症多组学数据的协同共表达网络;基于协同共表达网络,提取预后生物标志物;根据提取预后生物标志物,进行生存分析的样本聚类,并进行预后生存分析。本发明实现对癌症患者所属预后类别的精确预测,为生物学家揭示导致癌症预后生存差异的分子机制、辅助临床医生最终实现针对预后生物标志物的靶向精准化治疗提供统计支持。
本发明授权一种基于协同共表达网络的癌症预后生存分析方法在权利要求书中公布了:1.一种基于协同共表达网络的癌症预后生存分析方法,其特征是:包括以下步骤: 步骤1:基于公开数据库,收集癌症的多组学数据,并对数据进行预处理; 步骤2:基于处理后的数据,构建面向癌症多组学数据的协同共表达网络; 采用基于两两特征联合枚举的Cox回归来实现对预后生存时间的拟合,采用基于两两特征联合枚举的Pearson相关来衡量特征间的相关程度,统一基于两两特征联合枚举的Cox回归和基于两两特征联合枚举的Pearson相关两种度量,用于标注全连通网络中任意两结点边的权值;对其采用基于密度降序的簇心自动搜索聚类算法删除网络中权值较低的边,以此实现网络构建与特征团挖掘,基于密度降序的簇心自动搜索算法用于对网络中所有边的权值进行密度降序聚类,将权值密度较低的边从网络中删除,直到出现不连通的特征团为止; 协同共表达网络以单个特征为网络结点,以两两特征之间的关系为边,通过综合特征与生存时间的显著关系以及特征之间的相关关系计算结点间边的权值;构建如下度量方式用于衡量结点间边的权值: 其中,和分别代表联合两两特征和所得的二元Cox回归重排序p值,和分别代表单个特征和所得的一元Cox回归重排序p值,代表向上取整;的第一项为衡量特征和对生存回归贡献的“协同”部分,第二项源于基于Pearson相关的两两特征联合枚举所得的重排序p值,对应于“共表达”部分;用于衡量结点和之间的关联关系:其值越大,越表明结点和结点可能源于相同的特征团,反之亦然,当的值小于零时,将其值置为网络中权值的最大值,以此将所建的加权无向图称为协同-共表达网络; 步骤3:基于协同共表达网络,提取预后生物标志物; 步骤4:根据提取的预后生物标志物,进行生存分析的样本聚类,并进行预后生存分析。
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