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杭州碳硅智慧科技发展有限公司;之江实验室张徐俊获国家专利权

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龙图腾网获悉杭州碳硅智慧科技发展有限公司;之江实验室申请的专利分子结合构象确定方法及装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116580764B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-12发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310452223.0,技术领域涉及:G16B15/30;该发明授权分子结合构象确定方法及装置是由张徐俊;侯廷军;陈广勇;谢昌谕;康玉;沈超;王哲;王天玥;王二成;邓亚峰;施慧设计研发完成,并于2023-04-21向国家知识产权局提交的专利申请。

分子结合构象确定方法及装置在说明书摘要公布了:本申请提供了一种分子结合构象确定方法及装置。包括:获取化学分子对应的分子图,及蛋白质对应的残基图;将所述分子图和所述残基图输入至分子对接模型,所述分子对接模型包括:分子图编码网络层、残基图编码网络层和构象预测网络层;调用所述分子图编码网络层对所述分子图进行处理,更新所述分子图的分子节点特征,并调用所述残基图编码网络层对所述残基图进行处理,更新所述残基图的蛋白节点特征;调用相互作用构建模块对更新后的残基图和分子图进行图节点对并新增边处理,得到相互作用图;调用所述构象预测网络层对所述相互作用图进行处理,得到所述化学分子与所述蛋白质之间的分子结合构象。本申请可以提高结合构象的预测精度和预测速度,以及虚拟筛选的筛选能力和命中率。

本发明授权分子结合构象确定方法及装置在权利要求书中公布了:1.一种分子结合构象确定方法,其特征在于,所述方法包括: 获取化学分子对应的分子图,及蛋白质对应的残基图; 将所述分子图和所述残基图输入至分子对接模型,所述分子对接模型包括:分子图编码网络层、残基图编码网络层和构象预测网络层; 调用所述分子图编码网络层对所述分子图进行处理,更新所述分子图的分子节点特征,并调用所述残基图编码网络层对所述残基图进行处理,更新所述残基图的蛋白节点特征; 调用相互作用构建模块对更新后的残基图和分子图进行图节点对并新增边处理,得到相互作用图; 调用所述构象预测网络层对所述相互作用图进行处理,得到所述化学分子与所述蛋白质之间的分子结合构象; 所述分子图编码网络层包括:线性层和多头注意力图神经网络层,所述调用所述分子图编码网络层对所述分子图进行处理,得到所述分子图的分子节点特征,包括:调用所述线性层对所述分子图内的节点特征和边特征进行维度统一处理,得到维度统一的节点特征和边特征;调用所述多头注意力图神经网络层对所述维度统一的节点特征和边特征进行特征处理,得到所述分子图的分子节点特征; 所述调用所述残基图编码网络层对所述残基图进行处理,得到所述残基图的蛋白节点特征,包括:调用所述残基图编码网络层对所述蛋白质的序列信息的编码特征和所述残基图内的残基节点特征进行拼接处理,得到残基拼接特征;调用所述残基图编码网络层对所述残基拼接特征进行处理,得到所述残基图的蛋白节点特征; 所述调用所述构象预测网络层对所述相互作用图进行处理,得到所述化学分子与所述蛋白质之间的预测分子结合构象,包括:对所述相互作用图内的节点向量表征进行归一化处理,得到归一化节点向量表征,并对所述相互作用图内的边向量表征进行维度转换处理,得到维度转换向量表征;调用所述构象预测网络层对所述归一化节点向量表征和所述维度转换向量表征进行处理,得到所述化学分子与所述蛋白质之间的分子结合构象。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人杭州碳硅智慧科技发展有限公司;之江实验室,其通讯地址为:310018 浙江省杭州市钱塘新区下沙街道福城路291号和达药谷中心6幢337室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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