西湖大学郭天南获国家专利权
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龙图腾网获悉西湖大学申请的专利一种基于压力的蛋白分子间亲和力的检测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116699043B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-12发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310109993.5,技术领域涉及:G01N30/06;该发明授权一种基于压力的蛋白分子间亲和力的检测方法是由郭天南;刘志伟;张芳菲设计研发完成,并于2023-02-14向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于压力的蛋白分子间亲和力的检测方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种基于压力的蛋白分子间亲和力的检测方法。该方法基于随着压力增强,分子间相互作用力逐渐被破坏的原理,使用压力循环仪PCT提供不同的压力环境,之后使用体积排阻柱分馏和DIA质谱检测分析定量每个馏分中的分子信息,用于计算在不同压力下每个分子在不同馏分中分布的差异,从而推算出不同的分子间相互作用力的大小。该方法为含有蛋白的样本提供均一的能量,可以更稳定、更高效、更高通量地测量分子间亲和力。
本发明授权一种基于压力的蛋白分子间亲和力的检测方法在权利要求书中公布了:1.一种基于压力检测蛋白分子间亲和力的方法,包括以下步骤: 1)将生物组织样品在P 1至P n的一系列压力下分别进行裂解,得到一系列裂解物,其中P 1表示第一压力,P n表示第n压力,n为3以上的整数,相邻两个压力之差为定值; 2)对步骤1)得到各个压力下的一系列裂解物进行离心,取上清,分别进行基于尺寸排阻色谱SEC的高效液相色谱分离,并收集馏分; 3)将步骤2)收集的馏分分别使用胰蛋白酶进行蛋白酶解为肽段; 4)对步骤3)蛋白酶解后的不同馏分分别以数据非依赖型采集(DIA)方式进行质谱数据采集; 5)对步骤4)中采集到的不同馏分的DIA质谱数据进行蛋白质搜库分析以获得蛋白质定量矩阵; 6)通过蛋白质定量矩阵,推断出生物组织样品中的蛋白分子在不同馏分中的丰度分布; 7)对各个馏分进行分组生成不同的窗口,根据要分析分子间作用力的目标蛋白分子对在各组馏分中的丰度分布进行相关性分析以计算出目标蛋白分子对的对应于各组馏分的相关系数; 8)基于目标蛋白分子对的对应于各组馏分的相关系数,鉴定目标蛋白分子对之间是否存在相互作用峰; 9)在目标蛋白分子对之间存在相互作用峰的情况下,利用各个压力下的蛋白质定量矩阵计算对应的相互作用峰的峰面积,并通过以下公式计算蛋白分子对的亲和力系数AF,其中,所述AF越大,所述目标蛋白分子对之间的亲和力越强: 在以上公式中,表示第一压力下的相互作用峰的峰面积,表示第n-1压力下的相互作用峰的峰面积,为第n压力下的相互作用峰的峰面积,表示第n-j-1压力下的相互作用峰的峰面积,表示第n-j压力下的相互作用峰的峰面积; 为相邻压力区间P n-j-1和P n-j的权重,表示对应的相邻压力区间的相互作用峰的峰面积变化程度-对于亲和力系数AF的影响程度,其中,为压力区间系数,为大于1的常数。
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