中国科学院深圳先进技术研究院聂子昂获国家专利权
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龙图腾网获悉中国科学院深圳先进技术研究院申请的专利DNA数据编解码方法、装置、计算机设备及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116864006B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-15发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310847818.6,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权DNA数据编解码方法、装置、计算机设备及存储介质是由聂子昂;王洋;黄小罗;叶可江;须成忠设计研发完成,并于2023-07-11向国家知识产权局提交的专利申请。
本DNA数据编解码方法、装置、计算机设备及存储介质在说明书摘要公布了:本申请涉及一种DNA数据编解码方法、装置、计算机设备以及存储介质。所述方法包括:使用深度优先搜索算法对生成的基础碱基序列进行筛选,得到符合预设条件的基础碱基序列;从所述筛选后的基础碱基序列中选择第一设定数量的基础碱基序列作为二进制数据编码时使用的基础碱基序列并构建映射表,选择第二设定数量的基础碱基序列作为用于替换禁忌序列的替换序列;根据映射表将待编码的二进制数据编码为DNA链的碱基序列,并利用所述替换序列对所述碱基序列中的禁忌序列进行替换。本申请实施例能够将任意的二进制数据编码为碱基序列,生成的碱基序列中不包含过长同聚物及禁忌序列,且GC含量均衡,能够降低自行折叠产生二级结构的概率。
本发明授权DNA数据编解码方法、装置、计算机设备及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种DNA数据编解码方法,其特征在于,包括: 设定初始序列,在初始序列结尾依次添加碱基,生成DNA链的基础碱基序列,并使用深度优先搜索算法对所述基础碱基序列进行筛选,得到符合预设条件的基础碱基序列;所述预设条件包括同聚物长度、GC含量以及禁忌序列; 从所述筛选后的基础碱基序列中选择第一设定数量的基础碱基序列作为二进制数据编码时使用的基础碱基序列,根据所述第一设定数量的基础碱基序列与二进制数据的映射关系构建映射表,并选择第二设定数量的基础碱基序列作为用于替换禁忌序列的替换序列; 根据所述映射表将待编码的二进制数据编码为DNA链的碱基序列,并利用所述替换序列对所述碱基序列中的禁忌序列进行替换; 所述使用深度优先搜索算法对所述基础碱基序列进行筛选,得到符合预设条件的基础碱基序列具体为: 设定一个空字符串的初始序列S; 在初始序列S的结尾依次添加A、T、G、C四种碱基,生成基础碱基序列S1、S2、S3…Sn,n代表生成的基础碱基序列的总数,并在每生成一个基础碱基序列后,使用深度优先搜索算法对该基础碱基序列进行搜索,判断所述基础碱基序列中是否存在长度大于第一预设值的同聚物,如果存在, 在所述基础碱基序列上停止搜索,并判断所述基础碱基序列的长度是否等于第二预设值,如果是, 判断所述基础碱基序列中碱基G和C的数量是否均达到第三预设值,如果是, 判断所述基础碱基序列中是否存在预先定义的禁忌序列,如果存在,删除所述禁忌序列;如果不存在,将所述基础碱基序列加入基础碱基序列集合中。
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