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北京大学白凡获国家专利权

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龙图腾网获悉北京大学申请的专利一种基于单细胞多组学测序分析T淋巴细胞TCR特点的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115995267B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-15发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202111213369.7,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种基于单细胞多组学测序分析T淋巴细胞TCR特点的方法是由白凡;邢旭东设计研发完成,并于2021-10-19向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于单细胞多组学测序分析T淋巴细胞TCR特点的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于单细胞多组学测序分析T淋巴细胞TCR特点的方法。该方法对特定病毒感染前后、治疗前后的不同患者样本进行单细胞测序,基于单细胞转录组测序数据构建单细胞基因表达矩阵并进行细胞类型的注释和分群,基于单细胞免疫组测序数据组装TCR序列并识别TCR链组成基因,然后评估和识别各细胞亚群稳定TCR的表达率,评估不同疾病状态的各细胞亚群克隆状态和各样本TCR组装与使用偏好性,以及分析同一患者治疗前后TCR的变化特点。本发明对于特定病毒感染机制的解析以及针对宿主免疫反应研发特定疫苗和药物疗法有着重要的意义。

本发明授权一种基于单细胞多组学测序分析T淋巴细胞TCR特点的方法在权利要求书中公布了:1.一种基于单细胞多组学测序数据全面分析病毒感染后T淋巴细胞TCR特点的方法,采集特定病毒感染前后、治疗前后的不同患者的样本进行单细胞测序,然后通过以下步骤进行分析: 1)基于单细胞转录组测序数据构建单细胞基因表达矩阵,并进行细胞类型的分群和注释; 2)基于单细胞免疫组测序数据组装TCR序列并识别TCR链组成基因; 3)结合表达数据识别各细胞亚群的稳定TCR表达率:对步骤1)获得的单细胞表达数据进行数据过滤和去噪,只保留高质量的单细胞表达数据;在步骤2)组装和识别的TCR序列后,只保留同时具有α和β链数据的TCR;识别出具有高质量单细胞表达数据且同时具有α和β链的TCR的细胞,从而获得各细胞亚群的稳定TCR表达率,即各细胞亚群中检测到稳定TCR的细胞数占总细胞数的百分比; 4)评估不同疾病状态的各细胞亚群克隆状态:定义每个独特的TRAs-TRBs对为一个克隆型,如果一个克隆型存在于至少两个细胞中,则携带该克隆型的细胞被认为是克隆的;同时评估不同疾病状态下的各细胞亚群中没检测到TCR、TCR不克隆以及TCR克隆的情况; 5)分析不同疾病状态下各样本TCR组装与使用偏好性:通过分析不同患者、不同疾病状态下各样本的TCRα和β链V-J基因配对使用的特点,解析不同疾病状态下各样本TCR组装与使用偏好性;具体是:对于每个样本,先获得该样本每个细胞TCR的克隆型组成,分别提取该细胞TRA和TRB中V-J基因的配对信息,进而统计该样本所有TCR中TRA和TRB的V-J基因配对使用的频率;统计好所有样本的TCRV-J配对使用情况后,将样本按照不同的疾病状态和不同的患者分组,选取每个样本中高频使用的V-J基因对绘制成图,展示不同患者之间特异性的和共享的V基因、J基因和V-J基因对,以及不同疾病状态之间特异性的和共享的V基因、J基因和V-J基因对,由此解析病毒感染后相比健康状态,以及抗病毒治疗后差异性的高频V-J基因对使用的偏好性; 6)分析同一患者治疗前后整体和特定细胞亚群的TCR变化的状态、特异性和多样性。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人北京大学,其通讯地址为:100871 北京市海淀区颐和园路5号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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