中南大学曾敏获国家专利权
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龙图腾网获悉中南大学申请的专利基于图卷积网络的lncRNA亚细胞定位预测方法、设备及介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115394348B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-19发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210829698.2,技术领域涉及:G16B5/00;该发明授权基于图卷积网络的lncRNA亚细胞定位预测方法、设备及介质是由曾敏;李敏;赵保莹设计研发完成,并于2022-07-15向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于图卷积网络的lncRNA亚细胞定位预测方法、设备及介质在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于图卷积网络的lncRNA亚细胞定位预测方法、设备及介质,方法包括:1将待测lncRNA序列转换为k‑mer形式的序列,以转换后序列中各k‑mer单元为节点进行构图得到带权有向图,并对图的边权进行标准化处理得到边权标准化的有向图;2基于word2vec技术提取有向图中各节点的分布式词向量,并嵌入到边权标准化的有向图中;3采用预先训练好的基于图卷积网络的预测模型,根据嵌入分布式词向量的有向图,对待测lncRNA序列进行亚细胞定位输出。本发明比传统机器学习模型和现有方法更好的预测性能。
本发明授权基于图卷积网络的lncRNA亚细胞定位预测方法、设备及介质在权利要求书中公布了:1.一种基于图卷积网络的lncRNA亚细胞定位预测方法,其特征在于,包括: (1)将待测lncRNA序列转换为k-mer形式的序列,以转换后序列中各k-mer单元为节点进行构图得到带权有向图,并对图的边权进行标准化处理得到边权标准化的有向图; 步骤(1)具体过程为: 将待测lncRNA序列转换为k-mer形式的序列,按顺序依次将每个k-mer单元分配到节点上,并将相邻的k-mer单元节点使用有向边连接,以及将其中k-mer单元相同的节点粘合为一个,并得到无权有向图,该无权有向图为待测lncRNA序列的deBruijn图; 基于相邻节点构成的k+1-mer单元的频数,给无权有向图中每条有向边分配权重,得到带权有向图; 按以下计算式对带权有向图中的边权进行标准化处理,得到边权标准化的有向图: ; 式中,表示从节点指向节点的有向边的原始分配权重,表示从节点指向节点的有向边的原始分配权重,表示从节点指向节点的有向边的原始分配权重,表示节点的所有邻居节点的集合,表示从节点指向节点的有向边在标准化处理后的权重; (2)基于word2vec技术提取有向图中各节点的分布式词向量,并嵌入到边权标准化的有向图中; (3)采用预先训练好的基于图卷积网络的预测模型,根据嵌入分布式词向量的有向图,对待测lncRNA序列进行亚细胞定位输出。
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