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浙江大学石恒波获国家专利权

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龙图腾网获悉浙江大学申请的专利一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117316276B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311404952.5,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法及其应用是由石恒波;张凯;冯弈方;刘建新设计研发完成,并于2023-10-27向国家知识产权局提交的专利申请。

一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明属于生物技术领域,具体公开了一种奶山羊产奶相关性状的全基因组关联分析方法及其应用。在两个西农萨能奶山羊群体中随机选择330只母羊作为全基因组关联分析的实验对象,收集其相关的产奶量、乳成分、乳房表型等性状,在泌乳期间进行血样采集,提取基因组DNA,经过检测所提取到的基因组DNA完整性、纯度及浓度,最终合格样品有298只进行重测序,然后对西农萨能奶山羊生产相关性状的7项指标进行全基因组关联分析,筛选候选基因,为今后优质奶山羊新品种选育提供理论支撑。

本发明授权一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤1、实验动物的养殖和挑选 将奶山羊进行常规舍饲,从泌乳期9-10个月的奶山羊群体中随机挑选若干只作为全基因组重测序的实验对象; 步骤2、样品采集及处理 包括羊血和羊乳采集: 选择在泌乳期间用EDTA-k2抗凝管进行采血,采完血之后需将抗凝管缓慢上下颠倒混匀,使血液与抗凝剂充分混合,并将采完血的抗凝管置于含有冰袋的保温箱内,运至实验室后,放于-80℃冰箱储存备用; 羊乳的采集选择在泌乳期间用提前放好防腐剂的离心管收集,并摇匀混合,采集完成后将离心管置于含有冰袋的保温箱内,运至检测中心; 步骤3、产奶相关数据收集及乳房表型测定 收集的数据包括产奶量、乳成分、乳房宽度和乳房深度这两个表型;其中乳成分测定从泌乳开始后每月测定一次;产奶量从泌乳开始逐天记录;乳房表型利用imageJ软件对后躯照片进行测量; 步骤4、基因组DNA的提取及检测 基因组DNA的提取采用十六烷基三甲基溴化铵法,按照常规提取步骤提取基因组DNA,提取到的基因组DNA进行完整性、纯度及浓度的检测,符合要求的保留,不符合要求的淘汰或进行重新提取再检测; 步骤5、测序数据质控及与参考基因组比对统计 实验按照Illumina公司提供的标准protocol执行,对检测合格的基因组DNA样品,通过凝胶电泳的方法选择合适的大小片段,然后通过PCR扩增建库,再对建好的文库进行质量检测,合格的文库再用Illumina测序; 步骤6、数据处理和统计分析 1产奶相关性状描述性统计分析 产奶相关性状的描述性统计分析通过IBMSPssStatistics21.0软件中分析-描述统计分析获得,分析的生产性状指标包括:产奶量、乳糖、乳脂、乳蛋白、乳房宽度、乳房深度、乳房底平面长度; 分析的结果为样本数、平均数、方差、标准差及变异系数; 2全基因组关联分析 测序数据经过质控和填充之后,使用GMAT软件进行关联分析,挖掘出与萨能奶山羊产奶性能相关的SNPs: y=Xβ+Zkγk+ξ+p+e1 公式中,y为表型向量,Xβ为群体结构效应和场、胎次固定效应,Zkγk为待检验标记效应,ξ~N0,Kφ2为多基因效应,p~N0,Iσp2为系统环境效应,e~N0,Iσ2为残差效应;多基因效应中的K为标记推断的亲缘关系矩阵; 3群体分层 对奶山羊生产相关性状指标绘制Q-Q图,来判断关联分析中是否出现偏差和样本群体分层现象; 4显著SNPs基因注释 在获得全基因组关联分析的显著SNPs位点后,下载该位点上下游100kb的碱基序列,通过NCBI和Ensembl数据库进行序列比对,确定显著SNPs位点附近的基因,并筛选出与该位点距离最近的基因。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人浙江大学,其通讯地址为:310058 浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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