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中国科学院遗传与发育生物学研究所谢菁忠获国家专利权

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龙图腾网获悉中国科学院遗传与发育生物学研究所申请的专利一种植物与病原菌基因互作的双向关联分析方法及应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120108498B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-02发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510172093.4,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权一种植物与病原菌基因互作的双向关联分析方法及应用是由谢菁忠;赵彩虹;贺飞;罗巧玲;王利敏;尹谋;王豪杰;王一波设计研发完成,并于2025-02-17向国家知识产权局提交的专利申请。

一种植物与病原菌基因互作的双向关联分析方法及应用在说明书摘要公布了:本发明公开了一种植物与病原菌基因互作的双向关联分析方法及应用,属于生物技术领域。包括以下步骤:(1)获得植物的遗传变异信息,病原菌的遗传变异信息和植物对病原菌的抗感表型;(2)正向全基因组关联分析,从植物抗病基因出发定位病原菌效应因子;(3)反向全基因组关联分析,从病原菌效应因子出发定位植物抗病基因;(4)正向全基因组关联分析和反向全基因组关联分析得到的抗病基因与效应因子相同,二者即为植物与病原菌中互作的基因对。本发明提供的方法能够高效、准确并且同时筛选出植物抗病基因与病原菌效应因子的互作基因对,为解析植物抗病基因发挥的抗性机制提供有力的支持,并为培育持久和广谱的抗病植物新品种奠定基础。

本发明授权一种植物与病原菌基因互作的双向关联分析方法及应用在权利要求书中公布了:1.一种植物与病原菌基因互作的双向关联分析方法,其特征在于,包括以下步骤: (1)获得植物的遗传变异信息、病原菌的遗传变异信息和植物对病原菌的抗感表型;所述植物的遗传变异信息为单核苷酸多态性,所述病原菌的遗传变异信息为单核苷酸多态性; (2)正向全基因组关联分析,从植物抗病基因出发定位病原菌效应因子: ①对所述植物的遗传变异信息和植物对病原菌的抗感表型进行全基因组关联分析,得到植物基因组上的变异位点与植物对病原菌抗感表型的关联结果,绘制曼哈顿图并识别候选峰; ②从候选峰中识别出植物中的候选抗病基因; ③结合植物对病原菌的抗感表型,鉴定出候选抗病基因的抗病单倍型;具体操作为:候选抗病基因上相邻的SNP位点串在一起组合成候选抗病基因的单倍型,将基因的不同单倍型与植物对病原菌的抗感表型使用卡方检验、逻辑回归、方差分析和或Kruskal-Wallis检验进行关联分析,评估单倍型与表型之间的关联显著性,选出候选抗病基因的抗病单倍型; ④将病原菌对含有候选抗病基因的抗病单倍型的植株的侵染表型作为性状,将所述性状与病原菌的遗传变异信息进行全基因组关联分析,定位出病原菌基因组上的候选效应因子; (3)反向全基因组关联分析,从病原菌效应因子出发定位植物抗病: ①对所述病原菌的遗传变异信息和植物对病原菌的抗感表型进行全基因组关联分析,得到病原菌基因组上的变异位点与植物对病原菌抗感表型的关联结果,绘制曼哈顿图并识别候选峰; ②从候选峰中识别出病原菌中的候选效应因子; ③结合植物对病原菌的抗感表型,鉴定出候选效应因子的无毒单倍型; ④将植物对含有候选效应因子的无毒单倍型的菌株的抗感表型作为性状,将所述性状与植物的遗传变异信息进行全基因组关联分析,定位出植物基因组上的候选抗病基因; (4)所述步骤(2)和所述步骤(3)得到的候选抗病基因与候选效应因子相同,二者即为植物与病原菌中互作的基因对。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国科学院遗传与发育生物学研究所,其通讯地址为:100101 北京市朝阳区北辰西路1号院2号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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