慕恩(广州)生物科技有限公司张陈陈获国家专利权
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龙图腾网获悉慕恩(广州)生物科技有限公司申请的专利一种生物标志物的筛选方法及其相关应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114974432B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210770641.X,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种生物标志物的筛选方法及其相关应用是由张陈陈;梁雅俊;朱瑞娟;兰周;常曌;张东亚;蒋先芝设计研发完成,并于2022-06-30向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种生物标志物的筛选方法及其相关应用在说明书摘要公布了:本发明公开了一种生物标志物的筛选方法及其相关应用,涉及生物检测技术领域。本发明提供了一种筛选生物标志物的方法,无需通过测量仪器对菌株的代谢产物进行检测,而是直接通过对菌株基因组序列的功能预测来预测每个菌种的代谢产物,并形成代谢产物序列库,后续利用宏基因组测序数据和菌株序列库及代谢产物序列库分别进行比对,计算每个菌种的丰度及每种代谢产物的丰度,然后基于菌种丰度和代谢产物丰度,以及代谢产物和菌种的对应关系,对菌种进行筛选。在未实际测量代谢物的情况下,也能基于菌种和代谢物两个方面来筛选。显著降低了开发疾病诊断和疗效预测的标志物以及药物筛选的时间和成本,为疾病机制的研究和药物开发提供了新途径。
本发明授权一种生物标志物的筛选方法及其相关应用在权利要求书中公布了:1.一种微生物标志物的筛选方法,其特征在于,其包括以下步骤: S1:建立代表菌株基因组序列库:对获得的基因组序列库中的序列按照设定阈值进行聚类,获得不同株水平和或种水平的菌株簇;筛选获得每个菌株簇的代表菌株序列以建立代表菌株基因组序列库; S2:建立代谢产物基因簇序列库:对获得的基因组序列库的序列进行基因注释并预测每个菌株和或每个菌种的代谢产物基因簇,通过对代谢产物基因簇进行相似度聚类以获得基因簇家族,将基因簇家族合并获得代谢产物基因簇序列库;步骤S1和步骤S2的操作顺序可以互换或步骤S1和步骤S2可以同时进行; S3:获取样本的宏基因组测序数据,将宏基因组测序数据分别与步骤S1所述的代表菌株基因组序列库、步骤S2所述的代谢产物基因簇序列库进行比对,获得每个菌株和或每个菌种的相对丰度以及代谢产物的相对丰度; S4:筛选显著差异菌株和或菌种以及显著差异代谢产物; S5:将菌株或菌种、及其代谢产物均具有显著差异的候选菌株或候选菌种作为微生物标志物。
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