领星生物科技(上海)有限公司;启东领星医学检验实验室有限公司;上海领安生物科技有限公司许强获国家专利权
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龙图腾网获悉领星生物科技(上海)有限公司;启东领星医学检验实验室有限公司;上海领安生物科技有限公司申请的专利检测肿瘤发展的系统和方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114774520B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210425900.5,技术领域涉及:C12Q1/6809;该发明授权检测肿瘤发展的系统和方法是由许强;王冠;戴春设计研发完成,并于2016-11-17向国家知识产权局提交的专利申请。
本检测肿瘤发展的系统和方法在说明书摘要公布了:本专利公开了一种检测患者肿瘤负荷的方法,通过从患者肿瘤组织样本中提取DNA,选择预定数量的生物标志基因,以形成生物标志基因簇“定制基因簇”;分离患者体液中循环游离细胞的DNA样本;富集游离DNA片段中含生物标志基因的DNA序列;对富集的DNA进行测序;对富集DNA中的突变DNA和正常DNA序列计数;获得患者的肿瘤负荷。优选的,与治疗相关的基因“药物靶向基因”突变的检测与定制基因簇的检测同时进行。
本发明授权检测肿瘤发展的系统和方法在权利要求书中公布了:1.生物标志基因簇在制备用于检测肿瘤负荷的系统中的用途,其中所述检测肿瘤负荷包括步骤: a.从患者的肿瘤组织样本提取的DNA中选择预定数量的生物标志基因以形成生物标志基因簇; b.从患者的体液样本中分离循环的游离细胞DNA; c.从游离细胞DNA片段中富集含有生物标志基因的DNA序列; d.对富集的DNA进行测序; e.对富集DNA中的突变DNA和正常DNA序列分别计数;和 f.获得患者的肿瘤负荷; 其中所述生物标志基因簇包括5-10个、11-20个或21-30个生物标志基因;并且其中所述选择预定数量的生物标志基因包括以下步骤: a.确定患者肿瘤组织样本中提取的DNA的体细胞突变; b.就每种体细胞突变计算体细胞突变的克隆比率CR,包括确定肿瘤组织中肿瘤细胞百分比TP,对于每种体细胞突变,确定体细胞突变等位基因比率SA,对于每种体细胞突变,确定在正常组织中与体细胞突变连锁的预定数量的胚系杂合体SNPs测序获得的杂合率的平均值PLG,就每种体细胞突变,确定拷贝数改变值CNVR,通过公式计算体细胞突变克隆比:; c.对所有的体细胞突变的体细胞突变克隆比率进行排名;和 d.从排名最高的体细胞突变中选择预定数量的体细胞突变作为生物标志基因; 其中,所述确定肿瘤组织中肿瘤细胞百分比的步骤包括从正常组织的常规SNPs中选择胚系杂合体SNP位点THS,检测肿瘤组织中的THS,绘制THS等位基因比的密度曲线,依据肿瘤组织中检测到的THS计算肿瘤组织中肿瘤细胞百分比; 所述检测肿瘤组织中的THS的步骤包括调用肿瘤组织中每个THS等位基因比,用算法使THS等位基因比的密度曲线平滑,识别肿瘤组织THS密度曲线中两个小肩峰位置,用公式TP=100-A+B2+A100计算肿瘤组织中肿瘤细胞百分比,所述A为识别的第一个小肩峰位置,且B为识别的第二个小肩峰位置。
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