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龙图腾网获悉安徽大学申请的专利一种基于谱构效关系的蛋白质从头逆向设计方法及系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119296655B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-09发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411316576.9，技术领域涉及：G16B40/20；该发明授权一种基于谱构效关系的蛋白质从头逆向设计方法及系统是由叶盛;朱吕帅设计研发完成，并于2024-09-20向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于谱构效关系的蛋白质从头逆向设计方法及系统在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基于谱构效关系的蛋白质从头逆向设计方法及系统，方法包括：获取数据集，数据集包括蛋白质结构特征数据、蛋白质模拟光谱数据，以及蛋白质‑配体相互作用数据；建立多任务神经网络模型，使用数据集对其训练，输入蛋白质模拟光谱数据至训练好的多任务神经网络模型中，同时获取蛋白质骨架原子之间距离矩阵和蛋白质氨基酸个数；将蛋白质骨架原子之间距离矩阵和蛋白质氨基酸个数整合，获取最终蛋白质距离矩阵；根据最终蛋白质距离矩阵获取初始蛋白质PDB结构；利用SCUBA‑D蛋白质结构优化模型对初始蛋白质PDB结构进行优化，获取全原子蛋白质结构；应用ProteinMPNN，将全原子蛋白质结构作为输入，获取多个氨基酸序列。本发明能够加速药物的开发周期。

本发明授权一种基于谱构效关系的蛋白质从头逆向设计方法及系统在权利要求书中公布了：1.一种基于谱构效关系的蛋白质从头逆向设计方法，其特征在于，包括： S10，获取数据集，其中，数据集包括蛋白质结构特征数据、蛋白质模拟光谱数据，以及蛋白质-配体相互作用数据； S20，建立多任务神经网络模型，使用数据集对其训练，输入蛋白质模拟光谱数据至训练好的多任务神经网络模型中，同时获取蛋白质骨架原子之间距离矩阵和蛋白质氨基酸个数； S30，将蛋白质骨架原子之间距离矩阵和蛋白质氨基酸个数整合，获取最终蛋白质距离矩阵； S40，根据最终蛋白质距离矩阵获取初始蛋白质PDB结构； S50，利用SCUBA-D蛋白质结构优化模型对初始蛋白质PDB结构进行优化，获取全原子蛋白质结构； S60，应用ProteinMPNN，将全原子蛋白质结构作为输入，获取多个氨基酸序列； 多任务神经网络模型的网络架构包括：输入层、卷积层、全连接层、多层特征提取层、特征融合层和输出层；其中， 输入层，用于对蛋白质模拟光谱数据进行归一化预处理； 卷积层，用于提取蛋白质模拟光谱数据中的空间特征； 全连接层，用于将卷积层中提取的蛋白质模拟光谱数据中的空间特征映射到蛋白质的结构特征空间，获取初始蛋白质骨架原子之间距离矩阵； 多层特征提取层，包括第一层特征提取、第二层特征提取和第三层特征提取；且第一层特征提取至第三层特征提取的提取尺度依次增大；三层特征提取用于从初始蛋白质骨架原子之间距离矩阵中提取不同层级尺度的特征； 特征融合层，用于使用拼接函数，将多层特征提取层中提取的不同层级尺度的特征进行拼接融合，获取最终的蛋白质骨架原子之间距离矩阵； 输出层，包括蛋白质结构输出层和氨基酸个数输出层；蛋白质结构输出层直接输出最终的蛋白质骨架原子之间距离矩阵；将根据蛋白质骨架原子之间距离矩阵，获取蛋白质结构，将所有输出的蛋白质结构的特征长度统一，氨基酸个数输出层采用填充的方法，将缺少氨基酸的，填充无效信息，使所有输出的蛋白质结构的特征长度统一后，输出氨基酸个数。

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