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龙图腾网获悉四川大学申请的专利一种内含子保留水平控制方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119360958B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-12发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411565090.9，技术领域涉及：G16B20/50；该发明授权一种内含子保留水平控制方法是由胡肖;唐超;陈路;林静雯设计研发完成，并于2024-11-05向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种内含子保留水平控制方法在说明书摘要公布了：本发明涉及生物医学领域，具体涉及一种内含子保留水平控制方法，包括以下步骤：S101获得生物样本的转录组测序数据；S102获得基因表达矩阵数据；S103获得生物样本的全转录组内含子保留水平；S104获得潜在的RNA结合蛋白在生物样本中的转录组表达水平；S105将与全转录组内含子保留水平相关的潜在的RNA结合蛋白作为候选调控因子；S106确定候选调控因子作用于调控目标内含子的顺式调控元件区域；S107获得有效单核苷酸多态性位点和或有效简并碱基；S108实现对目标内含子保留事件的定向控制。本发明实现了对特定IR的调控因子和顺式调控元件的挖掘和定位，进而实现了对特定IR的定向控制。

本发明授权一种内含子保留水平控制方法在权利要求书中公布了：1.一种内含子保留水平控制方法，其特征在于，包括以下步骤： S101获得生物样本的转录组测序数据； S102获得所述转录组测序数据对应的基因表达矩阵数据； S103对所述转录组测序数据进行处理，获得所述生物样本中所有内含子保留事件的水平以及所有表达基因的内含子中发生内含子保留的比例，即所述生物样本的全转录组内含子保留水平；所述处理的方法具体包括：计算每一个内含子区域单碱基水平的覆盖度并以其中位数作为内含子区域的测序深度，要求所述内含子保留事件的内含子区域的整体覆盖率为100%；以所述内含子区域上下游的外显子区域的单碱基水平的覆盖度的中位数为参照，计算所述内含子保留事件的水平；然后根据内含子保留的定量结果，计算全转录组所有表达基因的内含子中发生内含子保留事件的比例，即获得所述生物样本的全转录组内含子保留水平； S104获得所述生物样本潜在的RNA结合蛋白，并基于所述基因表达矩阵数据，获得所述潜在的RNA结合蛋白在所述生物样本中的转录组表达水平； S105计算所述潜在的RNA结合蛋白与所述全转录组内含子保留水平之间的相关性，将与所述全转录组内含子保留水平之间相关的所述潜在的RNA结合蛋白作为候选调控因子； S106确定所述候选调控因子作用于调控目标内含子的顺式调控元件区域；所述S106步骤具体包括：利用CLIP染色质免疫沉淀技术对所述候选调控因子与目标RNA分子上发生物理结合的片段进行富集测序，基于发生所述目标内含子保留事件的位置处的所述候选调控因子的结合信号的富集情况，确定所述顺式调控元件区域； S107基于确定的所述顺式调控元件区域，分析所述候选调控因子以及所述顺式调控元件对目标内含子保留事件的调控方式，进而获得所述顺式调控元件区域的序列中能够影响所述目标内含子保留事件的有效单核苷酸多态性位点和或有效简并碱基；所述候选调控因子包括EIF4A3，所述顺式调控元件区域为5’剪接位点上游50nt的区域内，所述目标内含子包括NUP85第17号内含子； S108利用碱基编辑技术对细胞基因组中的所述有效单核苷酸多态性位点和或有效简并碱基进行编辑，进而实现在不影响蛋白质编码的情况下、对所述目标内含子保留事件的定向控制。

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