中南大学李敏获国家专利权
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龙图腾网获悉中南大学申请的专利基于大规模语言模型的多肽与TCR分子结合关系预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118942553B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411020937.5,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权基于大规模语言模型的多肽与TCR分子结合关系预测方法是由李敏;王猛;伍天睿设计研发完成,并于2024-07-29向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于大规模语言模型的多肽与TCR分子结合关系预测方法在说明书摘要公布了:本发明公开了基于大规模语言模型的多肽与TCR分子结合关系预测方法,其包括以下步骤:S100、获取待测结合关系的多肽序列和TCR分子上的CDR3片段序列,对待测序列分别进行预处理得到目标输入序列;S200、将所述目标输入序列中的每个氨基酸残基进行特征编码,输出每个序列的编码矩阵;S300、将所述编码矩阵分别输入至训练好的结合关系预测模型中的双向GRU模块中,输出每个序列的全局特征矩阵;S400、将所述每对序列的全局特征矩阵合并后,输入至训练好的结合关系预测模型中的大规模语言模型RetNet中,输出每对序列的关系矩阵;S500、将所述每对序列的关系矩阵输入至结合关系预测模型中,输出所述待测结合关系的多肽序列和TCR分子上的CDR3片段序列的结合概率。
本发明授权基于大规模语言模型的多肽与TCR分子结合关系预测方法在权利要求书中公布了:1.基于大规模语言模型的多肽与TCR分子结合关系预测方法,其特征在于,包括以下步骤: S100、获取待测结合关系的多肽序列和TCR分子上的CDR3片段序列,对待测序列分别进行预处理,得到目标输入序列; S200、根据从AAIndex数据库中提取的28个已成功应用于蛋白质结合领域的特征,作为目标输入序列中每个氨基酸残基的物理和化学特征的编码;将所述目标输入序列中的每个氨基酸残基进行特征编码,输出每个序列的编码矩阵; 其中,所述28个已成功应用于蛋白质结合领域的特征为CHOP780202、CIDH920103、CIDH920105、FAUJ880109、GEIM800106、KANM800102、KLEP840101、KRIW710101、PALJ810107、QIAN880123、RACS770103、RADA880108、ZIMJ680104、AURR980120、MUNV940103、NADH010104、FAUJ880111、FINA910104、GEIM800104、NADH010106、LIFS790101、MEEJ800101、OOBM770102、GUYH850105、ROSM880102、SWER830101、ZIMJ680102、MIYS990104; S300、将所述编码矩阵分别输入至训练好的结合关系预测模型中的双向GRU模块中,输出每个序列的全局特征矩阵; S400、将对应的所述每个序列的全局特征矩阵合并后,输入至训练好的结合关系预测模型中的大规模语言模型RetNet中,输出每对序列的关系矩阵; S500、将所述每对序列的关系矩阵输入至结合关系预测模型中,输出所述待测结合关系的多肽序列和TCR分子上的CDR3片段序列的结合概率。
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