华南理工大学蔡宏民获国家专利权
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龙图腾网获悉华南理工大学申请的专利基于孪生网络与多阶张量信息的基因功能诊断系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118412040B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410593811.0,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权基于孪生网络与多阶张量信息的基因功能诊断系统是由蔡宏民;王宇;王卓耀;郭效禹设计研发完成,并于2024-05-14向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于孪生网络与多阶张量信息的基因功能诊断系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于孪生网络与多阶张量信息的基因功能诊断系统,包括:数据管理模块,负责存储和管理基因组数据;数据导入模块,对基因组数据进行预处理,生成高质量基因功能特征矩阵;样本相似性模块,利用改进的相似性计算方法对高质量基因功能特征矩阵生成对应的样本相似信息;功能诊断训练模块,利用自动编码器将高质量基因功能特征矩阵转换为深度表征,并结合样本相似性模块与多阶张量相似性融合方式对改进的孪生网络进行训练;基因功能诊断预测模块,基于训练好的改进孪生网络进行基因功能智能诊断,结合基因本体注释并提供诊断结果的解释。本发明将多阶张量信息、孪生网络与基因组学数据结合,提升诊断能力与诊断结果可解释性。
本发明授权基于孪生网络与多阶张量信息的基因功能诊断系统在权利要求书中公布了:1.基于孪生网络与多阶张量信息的基因功能诊断系统,其特征在于,包括: 数据管理模块,负责存储和管理基因组数据,所述基因组数据被存储在数据库内,为系统提供数据存储和查询功能; 数据导入模块,用于加载基因测序数据,采取统计分析和语义相似度分析对所述数据管理模块中的数据进行预处理,进而在生物学背景基础上生成高质量基因功能特征矩阵; 样本相似性模块,利用改进的相似性计算方法对高质量基因功能特征矩阵生成对应的样本相似信息;其中,该改进的相似性计算方法是使用多个样本点度量准则来替代传统的度量准则,学习样本点之间的内在空间表达,并使用张量乘积技术实现样本表征与样本相似信息无损融合;所述样本相似性模块包括相似性张量构建过程和高阶相似性张量融合过程,针对高阶相似性张量融合过程,有: 关键在于有效利用样本之间内在的高阶相关性交互特征来指导表征的生成,采用张量mode-k乘积来无损融合基因组数据的内在高阶信息,mode-k乘积的定义如下: 式中,是定义的mode-k乘积符号,k为可变参数,能够设置具体数值,是m阶的张量,表示实数域,表示张量对应下标i1...ik-1ikik+1...im的具体元素值,n1,n2,…,nm表示第m个张量维度上的具体数值,im表示第m个张量维度中的子序号,0≤im≤nm,nk是第k个张量维度上的具体数值,ik表示第k个张量维度中的子序号,0≤ik≤nk,Vjik表示二维矩阵V对应下标jik的具体元素值; 融合张量相似性目的是通过多个样本之间的内在空间信息引导深度基因表征的生成,因此采取mode-k乘积来无损融合相似性张量与深度基因表征F之间的内在空间关联: 式中,表示m阶的相似性张量,是上述定义的mode-k乘积,将mode-k的可变参数k设置为张量的阶数m,是高质量基因功能特征矩阵的深度表征,其对应的第j列为F:,j; 功能诊断训练模块,利用自动编码器将所述数据导入模块中生成的高质量基因功能特征矩阵转换为相应的深度基因表征,在得到深度基因表征的基础上结合所述样本相似性模块对改进的孪生网络进行训练;其中,该改进的孪生网络是基于样本相似性模块所设计的多个样本点度量准则来计算深度基因表征的空间分布,引入了二元、三元和四元数据组之间的高阶关联,并使用张量乘积技术实现深度基因表征与样本相似信息无损融合;最后,将样本相似性模块与基因功能诊断任务结合,形成一个统一的学习框架,最终得到训练好的改进孪生网络,即最优诊断模型; 基因功能诊断预测模块,基于最优诊断模型进行基因功能智能诊断;其中,该基因功能诊断预测模块将基因功能划分为分子功能、细胞组件和生物过程三个关键性类别,结合外部基因本体注释数据库并提供诊断结果的解释。
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