北京普译生物科技有限公司;中国科学院生物物理研究所李清文获国家专利权
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龙图腾网获悉北京普译生物科技有限公司;中国科学院生物物理研究所申请的专利一种纳米孔测序方法、训练方法、电子设备及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120220809B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311824058.3,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种纳米孔测序方法、训练方法、电子设备及存储介质是由李清文;孙琛;娄继忠设计研发完成,并于2023-12-27向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种纳米孔测序方法、训练方法、电子设备及存储介质在说明书摘要公布了:本公开涉及一种纳米孔测序方法、训练方法、电子设备及存储介质,其中,测序方法包括:获取纳米孔测序信号;将所述纳米孔测序信号输入到测序模型中进行碱基识别,得到所述纳米孔测序信号对应的碱基序列;其中,所述测序模型为经过多个损失函数联合训练得到的模型,且所述测序模型中包括对所述纳米孔测序信号编码前进行降采样及编码后进行升采样的结构。通过本公开,提高了测序模型的推理精度及推理速度,将获取的纳米孔测序信号输入到测序模型中,可以快速准确地进行碱基识别,得到纳米孔测序信号对应的碱基序列,从而实现高精度快速纳米孔测序。
本发明授权一种纳米孔测序方法、训练方法、电子设备及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种纳米孔测序方法,其特征在于,所述方法包括: 获取纳米孔测序信号; 将所述纳米孔测序信号输入到测序模型中进行碱基识别,得到所述纳米孔测序信号对应的碱基序列;其中,所述测序模型为对预设模型经过多个损失函数联合训练得到的模型,且所述测序模型中包括对所述纳米孔测序信号编码前进行降采样及编码后进行升采样的结构:所述预设模型包括:共享编码器、联接主义时序分类CTC解码器和注意力解码器;其中,所述共享编码器用于对每组纳米孔测序训练信号进行编码;所述CTC解码器用于基于CTC的束搜索对所述共享编码器的编码结果进行解码,以得到所述每组纳米孔测序训练信号对应的第一碱基序列;所述注意力解码器用于基于注意力机制对所述共享编码器的编码结果进行解码,以得到所述每组纳米孔测序训练信号对应的第二碱基序列;所述多个损失函数包括:基于所述每组纳米孔测序训练信号对应的第一碱基序列及标准碱基序列确定的所述CTC解码器的损失函数,及基于所述每组纳米孔测序训练信号对应的第二碱基序列及所述标准碱基序列确定的所述注意力解码器的损失函数。
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