西安电子科技大学叶育森获国家专利权
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龙图腾网获悉西安电子科技大学申请的专利一种基于超图随机游走的scSPRITE数据补全方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116884498B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310621595.1,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种基于超图随机游走的scSPRITE数据补全方法是由叶育森;刘亚民;高琳设计研发完成,并于2023-05-29向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于超图随机游走的scSPRITE数据补全方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于超图随机游走的scSPRITE数据补全方法,包括以下步骤:S1,获取scSPRITE测序文档;S2,提取scSPRITE测序文档中的基因位点,并得到超边集合和超图节点集合;S3,计算每个超图的超边集合中每个超边的度以及超图节点集合中每个节点的度;S4,确定每个节点转移到下一节点的游走转移概率,获得每个超图的节点向量;S5,将每个超图的节点向量输入到Node2Vec模型中进行训练,输出每个超图的节点嵌入向量;S6,计算每个超图中每两个节点嵌入向量的相似度并筛选生成每个单细胞的交互矩阵。本发明的单细胞三维基因组结构补全方法能够定义少量群细胞的三维基因组结构,通过少量群细胞即可准确测序得到单细胞基因组结构,降低了测序工作的工作量,提高了测序效率。
本发明授权一种基于超图随机游走的scSPRITE数据补全方法在权利要求书中公布了:1.一种基于超图随机游走的scSPRITE数据补全方法,其特征在于,包括以下步骤: S1,获取scSPRITE测序文档; S2,提取所述scSPRITE测序文档中的基因位点,并根据所述基因位点得到每个单细胞的超边集合和超图节点集合;所述每个单细胞的超边集合和超图节点集合构成每个单细胞的超图; S3,计算每个超图的所述超边集合中每个超边的度以及所述超图节点集合中每个节点的度; S4,根据每个超图的所述每个超边的度以及所述每个节点的度确定每个节点转移到下一节点的游走转移概率,根据所述游走转移概率在每个超图上进行有偏随机游走,获得每个超图的节点向量; S5,将每个超图的所述节点向量输入到Node2Vec模型中进行训练,输出每个超图的节点嵌入向量; S6,计算每个超图中每两个所述节点嵌入向量的相似度并筛选生成每个单细胞的交互矩阵。
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