浙江工业大学黄金获国家专利权
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龙图腾网获悉浙江工业大学申请的专利一种基于随机森林筛选高活性色氨酸酶的方法及应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119724352B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-19发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411936314.2,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种基于随机森林筛选高活性色氨酸酶的方法及应用是由黄金;洪锐;刘李鸿;丁卫健;马兴杰设计研发完成,并于2024-12-26向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于随机森林筛选高活性色氨酸酶的方法及应用在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于随机森林筛选高活性色氨酸酶的方法及应用,本发明基于随机森林方法高效获得潜在高活性色氨酸酶编码基因,通过异源表达,获得含重组色氨酸酶的细胞,将其应用于DL‑色氨酸拆分,高效制备高纯度D‑色氨酸,解决了现有色氨酸酶筛选方法存在通量低、成本高、误差大、准确性差、工艺复杂等问题。本发明筛选的源自摩氏摩根氏菌的色氨酸酶基因进行了异源表达,所得到的重组菌株能够更加高效表达色氨酸酶,将含重组色氨酸酶的全细胞用于DL‑色氨酸的拆分,L‑色氨酸的水解率达到99.36%,得到产物D‑色氨酸的ee值达到99.23%。
本发明授权一种基于随机森林筛选高活性色氨酸酶的方法及应用在权利要求书中公布了:1.一种基于随机森林筛选高活性色氨酸酶的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤: (1)数据准备: 从NCBI中搜索来自细菌的色氨酸酶氨基酸序列,随机选取100条色氨酸酶氨基酸序列; (2)特征设定: a、蛋白质大小:候选蛋白质的长度400个氨基酸; b、色氨酸酶的两段必要保守序列:第一段为KKD,其中第二个K是与辅酶磷酸吡哆醛结合必要位点;第二段为任选7段保守区域TDS、TYT、TYE、RHXT、QTHXD、XRD、EXXR之一,X为任意氨基酸; (3)决策树分裂: 步骤(1)随机选取100条色氨酸酶氨基酸序列使用pycharm中的学习工具包scikit-learn进行模拟,决策树形成过程中每个节点按照步骤(2)的特征来分裂,一直到不能够再分裂为止; 学习工具包scikit-learn参数设置:估计器数量设为10,分裂准则选择基尼不纯度,最大深度设为None,最大特征数设为平方根,随机状态设为None,自助采样设为True,作业数设为None; (4)将步骤(3)中筛选得到的氨基酸序列与源自大肠杆菌K12的色氨酸酶ACE63255.1进行氨基酸序列比对,筛选同源性最高的氨基酸序列。
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