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宜明(苏州)细胞生物科技有限公司;南京鸿明生物科技有限公司赵晟获国家专利权

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龙图腾网获悉宜明(苏州)细胞生物科技有限公司;南京鸿明生物科技有限公司申请的专利一种三代测序的质控程序分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119673294B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-23发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510186878.7,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种三代测序的质控程序分析方法是由赵晟;刘玉兰;李刚;孙秀莲设计研发完成,并于2025-02-20向国家知识产权局提交的专利申请。

一种三代测序的质控程序分析方法在说明书摘要公布了:本发明提供了一种三代测序的质控程序分析方法,包括对抽提出的基因序列进行原始测序得到初始数据的POD5文本,然后将POD5文本转化成FASTQ文件,并去除Adapter数据,然后进行质量评估,得到Reads数据;将Reads数据与理论长度的目标碱基序列进行比对分析,过滤杂质,最终得到可视化的检测结果。本发明还提供一种基因的抽提方法,从原始数据获取、预处理、质量评估、比对分析到最后的报告生成,形成了一个高度优化且可靠的生物信息学分析流程。

本发明授权一种三代测序的质控程序分析方法在权利要求书中公布了:1.一种rAAV三代测序的质控程序分析方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤: S1a:对抽提出的基因序列进行原始测序得到初始数据的POD5文本,其中,所述基因序列的抽提包括: i:用蛋白酶K对rAAV纯化病毒进行破壳,得到初始反应溶液; ii:对所述初始反应溶液进行碱变性,中和后使用DNA产物纯化试剂盒进行纯化,然后用无核酸酶水洗脱,得到变性的病毒基因组DNA; iii:对所述变性的病毒基因组DNA进行孵育和退火,最终形成双链DNA,其中所述孵育和退火在45-70°C的温度下进行1小时;并且,所述基因序列的抽提不包括使用SSC溶液; S2a:对所述初始数据进行预处理,使用Dorado将所述POD5文本转化成FASTQ文件,并去除Adapter数据,得到第二数据; S3a:使用NanoPlot对所述第二数据进行质量评估,筛选Q值≥10的Reads数据; S4a:将所述Reads数据与理论长度的目标碱基序列通过Minimap2进行比对分析,得到第一统计结果; S5a:根据所述第一统计结果,对所述第二数据进行进一步筛选,过滤杂质,得到纯净的第三数据; 所述杂质为大于10000bp的长序列、低于500bp的短序列以及Q值小于10的序列; 所述纯净的第三数据为长度在500-10000bp以内且Q值大于或等于10的序列的数据 S6a:对所述纯净的第三数据进行序列长度分析和序列比对分析,得到检测结果; S7a:对检测结果去噪:所述去噪为通过设置阳性对照检测噪音,然后参照所述阳性对照的所述噪音去除所述检测结果的所述噪音,得到矫正结果,所述阳性对照为载体质粒酶切后得到的5'ITR-目标序列-3'ITR线性化片段,如SEQIDNO:2所示,且所述阳性对照与待测样品在相同测序环境下处理; S8a:使用NanoPlot、Minimap2和Pysamstats三款工具组合对校正后的数据进行序列长度分布和突变频率分析,输出质控报告。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人宜明(苏州)细胞生物科技有限公司;南京鸿明生物科技有限公司,其通讯地址为:215000 江苏省苏州市苏州工业园区新泽路1号生物医药产业园三期A区3号楼101单元;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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