中国农业科学院植物保护研究所周焕斌获国家专利权
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龙图腾网获悉中国农业科学院植物保护研究所申请的专利一种分析转基因植物中DNA整合信息的方法及用途获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114743595B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-23发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210384790.2,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种分析转基因植物中DNA整合信息的方法及用途是由周焕斌;李少芳设计研发完成,并于2022-04-13向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种分析转基因植物中DNA整合信息的方法及用途在说明书摘要公布了:本发明属于生物信息处理领域,公开了分析转基因植物中DNA整合信息的方法及用途,包括如下步骤:将转基因植物的基因组测序序列分别与植物的基因组序列和转基因载体序列对比,筛选比对到植物基因组和转基因载体序列的SCR;根据SCR对比位置将SCR分组;每个SCR分组中每条SCR未被比对的序列部分按照序列长度从长到短排列,如果短序列出现在长序列中,则短序列与长序列属于一个SCR亚组;每个SCR亚组中最长的未比到转基因载体的序列部分精确比对植物基因组和转基因载体序列,根据SCR亚组比对到转基因载体和植物基因组的信息获得转基因插入位点信息。本发明的方法可以评估转基因植物多种插入情形等插入片段分子特征。
本发明授权一种分析转基因植物中DNA整合信息的方法及用途在权利要求书中公布了:1.一种分析转基因植物中DNA整合信息的方法,其特征在于, 包括如下步骤: 步骤1:将所述转基因植物的基因组测序序列分别与所述植物的基因组序列和转基因载体序列比对,然后筛选比对到所述植物基因组和所述转基因载体序列的SCR; 步骤2:根据SCR比对到所述植物基因组和所述转基因载体的位置将SCR分组;每个SCR分组中每条SCR未被比对的序列部分按照序列长度从长到短排列,如果短序列出现在长序列中,则所述短序列与所述长序列属于一个SCR亚组,否则所述短序列成为新的SCR亚组; 步骤3: 比对到所述转基因载体序列的SCR分组中的每个SCR亚组中最长的未比对到所述转基因载体的序列部分精确比对所述植物基因组,比对到所述植物基因组的SCR分组中的每个SCR亚组中最长的未比对到所述植物基因组的序列部分精确比对所述转基因载体序列,根据所述SCR亚组比对到所述转基因载体和所述植物基因组的信息获得转基因插入位点信息; 将比对到所述植物基因组的SCR分组中的每个SCR亚组中最长的未比对到所述植物基因组的序列部分精确比对所述植物基因组序列;如果所述SCR亚组中最长的未比对到植物基因组的序列部分精确比对到所述植物基因组,则根据该SCR亚组信息以及所述转基因插入位点信息,获得转基因引起的所述转基因植物染色体重排信息; 将比对到所述转基因载体序列的SCR分组中每个SCR亚组中最长的未比对到所述转基因载体的序列部分精确比对所述转基因载体序列;如果所述SCR亚组中最长的未比对到转基因载体的序列部分精确比对到所述转基因载体,则根据该SCR亚组信息以及所述插入位点信息获得转基因载体片段串联插入信息。
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