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中国热带农业科学院环境与植物保护研究所岳政府获国家专利权

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龙图腾网获悉中国热带农业科学院环境与植物保护研究所申请的专利一种宏基因组数据集的生物地球化学元素循环分析方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119580852B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411653970.1,技术领域涉及:G16B50/10;该发明授权一种宏基因组数据集的生物地球化学元素循环分析方法及系统是由岳政府;邹雨坤;盛寿山;寇枘;张静;张菁;彭梁;许伟;杨霞;李勤奋设计研发完成,并于2024-11-19向国家知识产权局提交的专利申请。

一种宏基因组数据集的生物地球化学元素循环分析方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种宏基因组数据集的生物地球化学元素循环分析方法及系统,包括:获取原始实验数据,基于原始实验数据获得注释文件、样本分组文件与非冗余基因组概况文件;对注释文件、样本分组文件与非冗余基因组概况文件进行预处理,获得样本数据集;构建化学元素循环分析模型,基于样本数据集与化学元素循环分析模型获得化学元素的剖面文件;将化学元素的剖面文件按照所对应的实验处理条件进行分类整理,对每个分类进行统计分析后进行可视化处理,并存储统计分析结果与可视化处理结果。当用户需要对庞大的宏基因组数据集进行分析时,使用户能够全面、快速、灵活地获取到直观的微生物的相关信息。

本发明授权一种宏基因组数据集的生物地球化学元素循环分析方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种宏基因组数据集的生物地球化学元素循环分析方法,其特征在于,包括: 获取原始实验数据,基于原始实验数据获得注释文件、样本分组文件与非冗余基因组概况文件;对所述注释文件、所述样本分组文件与所述非冗余基因组概况文件进行预处理,获得样本数据集; 获得注释文件的过程包括: 对所述原始实验数据进行组装,对组装的长序列片段进行基因预测,并翻译得到氨基酸序列;将所述氨基酸序列与KEGG数据库和NR数据库进行比较,获得对应的KO条目,基于KO条目对所述氨基酸序列进行功能注释和分类注释,获得注释文件; 构建化学元素循环分析模型,基于所述样本数据集与所述化学元素循环分析模型获得化学元素的剖面文件; 所述化学元素循环分析模型包括四个循环分析分支,分别对应按照碳、氮、磷、硫四个化学元素; 基于所述样本数据集与所述化学元素循环分析模型获得化学元素的剖面文件的过程包括: 整理所述样本数据集中与对应化学元素循环相关的KO条目,基于所述KO条目提取丰度信息,根据化学元素循环过程对所述丰度信息进行合并,获得循环丰度数据集; 对所述循环丰度数据集进行正态性检验后进行显著性分析并将分析结果存储至命名为Heatmap的文件夹;其中,根据原始实验数据对应实验条件的种类数量与正态性检验结果选择显著性分析的方法; 检查预定义类别的碳循环基因ID,判断存在的类别;根据存在的类别创建碳循环途径文件夹,统计不同分类学层次的相关微生物并保存至对应的碳循环途径文件夹中; 对循环丰度数据集进行β-多样性分析评估微生物群落的相似性和差异性,对分析结果进行可视化,将可视化结果存储至与可视化方式相同命名的文件夹中; 将化学元素的剖面文件按照所对应的实验处理条件进行分类整理,对每个分类进行统计分析后进行可视化处理,并存储统计分析结果与可视化处理结果。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,其通讯地址为:571101 海南省海口市龙华区学院路4号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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