北京理工大学任姝获国家专利权
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龙图腾网获悉北京理工大学申请的专利基于反应分子动力学模拟的物种和反应空间信息分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119649924B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-30发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411790072.0,技术领域涉及:G16C10/00;该发明授权基于反应分子动力学模拟的物种和反应空间信息分析方法是由任姝;李根;甘强;仝程杰;陈忠辉;杨威;夏敏;杨帆致;王亚军;冯长根设计研发完成,并于2024-12-06向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于反应分子动力学模拟的物种和反应空间信息分析方法在说明书摘要公布了:本发明提供基于反应分子动力学模拟的物种和反应空间信息分析方法,涉及数据处理技术领域,该方法为基于自定义键级阈值,过滤初始化学键键级信息,得到自定义化学键信息;基于自定义化学键信息,根据化学键连接提取各分子中所有原子,得到完整分子信息;基于原子轨迹信息,比较相邻轨迹化学键信息,得到模拟过程完整反应信息;利用完整分子信息并结合原子轨迹信息,通过分子质心坐标计算,得到物种空间位置信息;利用模拟过程完整反应信息,结合物种空间位置信息,得到反应空间范围信息,完成对物种和反应空间信息的分析。本发明解决了大规模反应分子动力学模拟中物种空间信息和反应空间信息难以提取的问题。
本发明授权基于反应分子动力学模拟的物种和反应空间信息分析方法在权利要求书中公布了:1.基于反应分子动力学模拟的物种和反应空间信息分析方法,其特征在于,包括: S1:基于自定义键级阈值,过滤初始化学键键级信息,得到自定义化学键信息; S2:基于所述自定义化学键信息,根据化学键连接提取各分子中所有原子,得到完整分子信息; S3:基于原子轨迹信息,比较相邻轨迹化学键信息,获取成键信息和断键信息,提取所有化学反应中的反应物和生成物,得到模拟过程完整反应信息;基于原子轨迹信息,比较每两个相邻轨迹的化学键,获取后一轨迹的成键原子集合和断键原子集合: ; ; 其中,表示轨迹的自定义化学键信息,表示轨迹的自定义化学键信息,表示两组集合取幂集,表示断键原子集合,即当前轨迹中断裂的化学键集合,表示成键原子集合,即当前轨迹中生成的化学键集合; 基于任一成键原子集合和断键原子集合与前一轨迹所有分子的原子集合信息,通过求交集,得到当前轨迹所有化学反应的反应物集合;基于所述任一成键原子集合和断键原子集合与当前轨迹所有分子的原子集合信息,通过求交集,得到当前轨迹所有化学反应的生成物集合: ; ; 其中,表示当前轨迹所有化学反应的反应物集合,表示轨迹所有分子的原子集合并集,表示当前轨迹所有化学反应的生成物集合,表示轨迹所有分子的原子集合并集; 基于所述当前轨迹所有化学反应的反应物集合和所述当前轨迹所有化学反应的生成物集合,通过提取交集分别建立当前轨迹各反应子集,汇总所有子集,得到模拟过程完整反应信息: ; ;其中,表示轨迹一中不同分子的原子ID集合取并集得到的反应原子ID集合,表示轨迹二中不同分子的原子ID集合取并集得到的反应原子ID集合,表示轨迹三中不同分子的原子ID集合取并集得到的反应原子ID集合,表示轨迹中不同分子的原子ID集合取并集得到的反应原子ID集合,表示轨迹中不同分子的原子ID集合取并集得到的反应原子ID集合,表示轨迹中不同分子的原子ID集合取并集得到的反应原子ID集合,表示模拟过程完整反应信息,表示反应中反应物的原子ID集合,表示反应中生成物的原子ID集合;其中,,,,n表示当前轨迹发生的反应数; S4:利用所述完整分子信息并结合原子轨迹信息,获取分子结构信息,通过分子质心坐标计算,得到物种空间位置信息;利用所述模拟过程完整反应信息,结合所述物种空间位置信息,得到反应空间范围信息; S5:将所述物种空间位置信息和所述反应空间范围信息转换为一维列表数据,完成对物种和反应空间信息的分析。
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