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龙图腾网获悉西南民族大学申请的专利注释宏病毒组原始测序数据短读序列的方法、系统、存储介质和装置获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN114093416B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-03发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202111396291.7，技术领域涉及：G16B20/20；该发明授权注释宏病毒组原始测序数据短读序列的方法、系统、存储介质和装置是由汤承;岳华;周昱行设计研发完成，并于2021-11-23向国家知识产权局提交的专利申请。

本注释宏病毒组原始测序数据短读序列的方法、系统、存储介质和装置在说明书摘要公布了：本发明公开了注释宏病毒组原始测序数据短读序列的方法、系统、存储介质和装置，基于windows系统，方法包括以下步骤：获取原始测序数据，对原始测序数据进行解压并提取短读序列，生成短读序列数据集，调用blastn程序将数据集比对到数据库中；保留每条短读序列的最佳比对结果，并将最佳比对结果中比对质量差的结果去除，然后按照基因id添加病毒种名称；基于脚本库，统计注释到每个病毒种的短读序列数目，计算每个病毒种的短读序列在基因组上比对位置的标准偏差，并按照注释的病毒种提取对应的短读序列序列，输出fasta数据集。本发明实现了宏病毒组原始数据注释的本地化、轻便化，便于不具备生物信息学背景知识的研究人员使用。

本发明授权注释宏病毒组原始测序数据短读序列的方法、系统、存储介质和装置在权利要求书中公布了：1.一种注释宏病毒组原始测序数据短读序列的方法，基于windows系统，使用shell和perl编写，其特征在于：包括以下步骤： 检测特定目录下是否存在Blastn索引，如果不存在Blastn索引则进一步判断特定目录下是否存在用户提供的fasta数据集，如果存在用户提供的fasta数据集则基于所述fasta数据集构建新的Blastn索引，否则进一步判断特定目录下是否存在RefSeq病毒数据库，如果存在RefSeq病毒数据库则基于所述RefSeq病毒数据库构建新的Blastn索引，否则报错； 在存在Blastn索引的情况下，完成后续注释步骤；所述特定目录为windows系统创建的databases目录；对用户提供的fasta数据集构建新的Blastn索引，采用makeblastdb程序实现；如果databases目录下存在Blastn索引即为数据库文件，则直接进行下一步步骤；如果不存在Blastn索引，则程序利用自带的2021年RefSeq病毒基因序列数据集构建Blastn索引，然后进行下一步步骤；如果不存在Blastn索引且存在用户提供的带有gene id的fasta数据集，则程序会整合这个数据集以及原有的数据集以构建Blastn索引，然后进行下一步步骤；如果既不存在任何数据集即没有用户提供的带有gene id的fasta数据集，也没有自带的2021年RefSeq病毒基因序列数据集，也不存在Blastn索引，则程序会报错； 获取原始测序数据，对原始测序数据进行解压并提取短读序列，生成短读序列数据集，调用Blastn程序将数据集比对到数据库中； 保留每条短读序列的最佳比对结果，并将最佳比对结果中比对质量差的结果去除，然后按照基因id添加病毒种名称； 基于脚本库，统计注释到每个病毒种的短读序列数目，计算每个病毒种的短读序列在基因组上比对位置的标准偏差，并按照注释的病毒种提取对应的短读序列，输出fasta数据集； 其中，使用shell和perl编写，在windows上通过Gitbash提供全部所需环境，即shell和perl环境由Git for Windows程序提供；直接对Blastn结果中比对到各个病毒基因组的短读序列数进行统计即可得到丰度； 所述脚本库包括数据库自检脚本、毒株名添加脚本和短读序列提取脚本。

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