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杭州联川生物技术股份有限公司沈励泽获国家专利权

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龙图腾网获悉杭州联川生物技术股份有限公司申请的专利一种m6A高通量测序数据的分析方法和系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115775593B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211534711.8,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种m6A高通量测序数据的分析方法和系统是由沈励泽;陈丽;黎倩设计研发完成,并于2022-11-29向国家知识产权局提交的专利申请。

一种m6A高通量测序数据的分析方法和系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种m6A高通量测序数据生物信息分析方法,属于生物信息学技术领域。所述分析方法包括原始数据产出统计与预处理、数据污染过滤、测序数据与基因组比对、全基因组层面PeakCalling与注释、样本间差异Peak分析、基因序列motif分析、基因与lncRNA表达丰度分析、差异基因表达谱分析、差异lncRNA表达谱分析。利用本发明提供的分析方法,可以获得全面详实分析数据,能利用高通量测序手段从全基因组层面挖动物、植物以及临床样本的m6A甲基化修饰信息,为后续的科学研究提供帮助。

本发明授权一种m6A高通量测序数据的分析方法和系统在权利要求书中公布了:1.一种m6A-seq高通量测序数据的分析方法,其特征在于,包括以下步骤: S1,m6A-seq高通量测序数据进行处理,过滤掉不合格的序列,其中,所述m6A-seq测序数据来自至少一对配对的IP样本和Input样本; S2,利用包括核糖体RNA序列和或支原体RNA序列的数据库过滤掉污染序列; S3,将过滤后的序列与样本来源物种参考基因组进行比对,得到能比对到所述参考基因组上的Reads; S4,全基因组层面PeakCalling与注释:对能比对到所述参考基因组上的Reads进行全基因组层面的peak鉴定,得到peak在基因组上的位置及peak长度和Reads数量信息,对Peak在基因组上的位置进行注释,并对Reads在转录起始位置和终止位置分布进行分析; S5,差异Peak分析:取IP样本和Input样本交集的Peak进行差异Peak分析,得到具有差异的Peak,将具有差异的Peak对应的相关基因采用负二项式分布法进行GO和KEGG功能富集分析; S6,Peak序列motif分析:对步骤S4中得到的单个样本Peak以及步骤S5中得到的具有差异的Peak进行motif分析; S7,mRNA与lncRNA表达丰度分析:对样本中mRNA以及lncRNA的进行定量分析,得到每个mRNA和lncRNA在样本中的原始值Counts以及归一化表达量FPKM值; S8,差异mRNA和lncRNA表达谱分析:对IP样本和Input样本中的每个mRNA和lncRNA进行差异分析,并对所有差异相关基因采用负二项式分布法进行GO和KEGG功能富集分析。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人杭州联川生物技术股份有限公司,其通讯地址为:310018 浙江省杭州市杭州经济技术开发区6号大街260号16幢四层;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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