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北京工商大学赵磊获国家专利权

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龙图腾网获悉北京工商大学申请的专利一种识别酶的氨基酸候选突变位点的计算方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115841846B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211503973.8,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权一种识别酶的氨基酸候选突变位点的计算方法是由赵磊;王成涛;潘飞;赵亮;杨婷;刘雅琪;杨子辰设计研发完成,并于2022-11-28向国家知识产权局提交的专利申请。

一种识别酶的氨基酸候选突变位点的计算方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种识别酶的氨基酸候选突变位点的计算方法,所述计算方法包括酶蛋白铰链定位、残基进化保守性分析和能量计算。本发明首次采用整合酶蛋白铰链定位、残基进化保守性分析和能量计算三者一体化的方法筛选酶候选突变位点,实现了糖基转移酶突变位点的高精度快速筛选,显著提高了糖基转移酶对莱鲍迪苷DRebD生产莱鲍迪苷MRebM的酶活力,有效解决了该酶底物专一性差、催化活性不高等问题,降低生产成本,同时提高糖基转移酶的可溶性表达能力,有利于通过微生物发酵进行规模化生产,更适于商业和工业应用。

本发明授权一种识别酶的氨基酸候选突变位点的计算方法在权利要求书中公布了:1.一种识别酶的氨基酸候选突变位点的计算方法,其特征在于,所述计算方法包括酶蛋白质铰链定位、残基进化保守性分析和能量计算; 所述酶蛋白铰链定位利用DFI函数进行计算,所述DFI函数通过计算长时间分子动力学模拟下的残基相关性矩阵获取每个残基的动态弹性指数,所述残基相关性矩阵通过计算分子动力学模拟下的蛋白质Cα的运动轨迹并以协方差矩阵的形式提供蛋白质中Cα原子波动的成对相关性,所述协方差矩阵用于计算扰动力引起的残基响应向量的公式如式1所示; 式1; 其中,ΔR3N×1为扰动力引起的残基响应向量,G3N×3N为分子动力学模拟得到的协方差矩阵,F3N×1为扰动力向量; 按式2计算扰动响应矩阵; 式2; 其中,AN×N为扰动力依次作用于蛋白质中的Cα原子,所获得的扰动响应矩阵,|ΔR1|1为位于位点1的扰动在位点1产生的波动响应幅度,|ΔRN|1为位于位点N的扰动在位点1产生的波动响应幅度,|ΔR1|N为位于位点1的扰动在位点N产生的波动响应幅度,|ΔRN|N为位于位点N的扰动在位点N产生的波动响应幅度,N为大于等于1的自然数; 按式3计算位点i残基的DFI得分DFIi; 式3; 其中,DFIi为当酶蛋白链中的所有残基按顺序逐一被扰动时其净响应与所有残基被扰动时的净位移的比值,|ΔRj|i为位于位点j的扰动在位点i产生的波动响应幅度,i和j为大于等于1小于等于N的自然数; 所述残基进化保守性分析通过对目标酶家族的多序列比较计算每个氨基酸在自然进化中的突变频率; 所述能量计算利用MMPBSA自由能分解工具和酶与目标底物或产物复合物的长时间分子动力学下的运动轨迹进行计算。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人北京工商大学,其通讯地址为:100048 北京市海淀区阜成路33号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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