北京林业大学;浦因科技(上海)有限公司秦兴虎获国家专利权
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龙图腾网获悉北京林业大学;浦因科技(上海)有限公司申请的专利一种基于机器学习和DNA印记的濒危野生动物及其制品地理溯源方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119170102B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411193406.6,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种基于机器学习和DNA印记的濒危野生动物及其制品地理溯源方法及其应用是由秦兴虎;马书宝;张东;蓝贤娜;胡德夫;文嘉设计研发完成,并于2024-08-28向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于机器学习和DNA印记的濒危野生动物及其制品地理溯源方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于机器学习和DNA印记的濒危野生动物及其制品地理溯源方法及其应用,涉及野生动物及其制品地理溯源技术领域。方法包括应用机器学习方法对已知地理坐标的样品进行地理遗传结构推演并建立线性回归模型,依据线性回归模型对未知地理坐标的样品进行溯源两部分内容。本发明一种基于机器学习和DNA印记的濒危野生动物及其制品地理溯源方法及其应用,通过降维将原始测序获得的大量遗传标记简化为一组无法直接比较的简化特征,同时每个特征都包含了样本中个体的地理来源信息;在此基础上,通过简化特征训练建立线性回归模型,极大减少了训练成本;将方差最大的主成分映射到个体的地理坐标,通过线性回归模型达到追溯个体地理起源的效果。
本发明授权一种基于机器学习和DNA印记的濒危野生动物及其制品地理溯源方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种基于机器学习和DNA印记的濒危野生动物及其制品地理溯源方法,其特征在于,包括如下步骤: S1、应用KLFDAPC对样品进行遗传地理结构推演并建立线性回归模型,包括: S11、采样及测序,得到样品的简化基因组序列; S12、将步骤S1测序得到的简化基因组序列比对到参考基因组上并检测变异,合并各个样本的变异检测文件并设参数过滤,得到高质量变异位点; S13、以0、1、2编码基因型,对个体×基因型矩阵进行KLFDAPC分析溯源,包括: S131、利用PCA对个体×基因型矩阵进行降维,得到包含基因型中地理位置信息的主成分PCs; S132、对前20~50个标准化PC进行KLFDA分析,进一步提取主成分中的非线性特征; S133、利用普鲁克分析计算前两个主成分KLFDAPC1和KLFDAPC2与取样点的地理坐标相关性,通过平移、旋转和缩放建立主成分与地理坐标的转换,建立转换后主成分与经纬度的线性回归模型; 步骤S13中,0、1、2分别表示位点主等位基因纯合、杂合以及次等位基因纯合; S2、应用线性回归模型对未知地理坐标的样品溯源。
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