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上海唯可生物科技有限公司朱凤娇获国家专利权

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龙图腾网获悉上海唯可生物科技有限公司申请的专利一种基于靶向富集测序评估基因编辑脱靶风险的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119207553B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411391939.5,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种基于靶向富集测序评估基因编辑脱靶风险的方法是由朱凤娇;倪帅;阚科佳;王玉珏;侯宇宸;何峰;王威;吴宁设计研发完成,并于2024-10-08向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于靶向富集测序评估基因编辑脱靶风险的方法在说明书摘要公布了:本发明提供一种基于靶向富集测序评估基因编辑脱靶风险的方法,包括:分别采用多个预测软件筛选出脱靶序列并进行汇总,获得多个脱靶序列表,选择多个所述脱靶序列表中均出现且潜在脱靶风险高的脱靶序列作为脱靶位点;采用TES法对待测样本和对照样本基因组中所述脱靶位点进行高深度测序,所得测序结果与参考基因组进行比对,将比对结果进行突变检测和结构变异检测,获得仅存在于编辑样本中的突变位点和结构变异位点,并以此鉴定脱靶位点的真实性;评估脱靶风险和编辑效果;对所述脱靶位点信息进行可视化,并自动化生成脱靶风险评估报告。该评估方法具有高灵敏性和高特异性,能够提升基因编辑脱靶检测的准确性和敏感度,并显著降低整体测序成本。

本发明授权一种基于靶向富集测序评估基因编辑脱靶风险的方法在权利要求书中公布了:1.一种基于靶向富集测序评估基因编辑脱靶风险的方法,其特征在于,所述方法包括: 分别采用预测软件Cas-Offinder、CRISPOR、COSMID、CCTop和GUIDES在全基因组范围内,筛选与on-targetsgRNA具有相同长度和相同PAM的序列,将筛选出的序列与on-targetsgRNA进行比对,筛选出脱靶序列; 分别将Cas-Offinder、CRISPOR、COSMID、CCTop和GUIDES筛选出的所述脱靶序列进行汇总,获得脱靶序列表,选择不同所述脱靶序列表中均出现且潜在脱靶风险高的所述脱靶序列作为脱靶位点; 采用靶向富集测序法对待测编辑样本和对照未编辑样本基因组中所述脱靶位点进行高深度测序,获得待测编辑样本脱靶位点序列和对照未编辑样本脱靶位点序列; 分别将所述待测编辑样本脱靶位点序列和所述对照未编辑样本脱靶位点序列与参考基因组进行比对,获得markdupbam文件; 将所述markdupbam文件进行突变检测、突变信息注释和突变位点过滤,获得仅存在于待测编辑样本中的突变位点; 将所述markdupbam文件进行结构变异检测、结构变异信息注释和结构变异位点过滤,获得仅存在于待测编辑样本中的结构变异位点; 将所述脱靶位点、所述仅存在于待测编辑样本中的突变位点和所述仅存在于待测编辑样本中的结构变异位点进行数据整合,经对比分析,鉴定所述脱靶位点的真实性; 评估sgRNA的脱靶风险和编辑效果; 对所述脱靶位点信息进行可视化,展示所述脱靶位点的分布、频率和与目标编辑位点的关系,并自动化生成脱靶风险评估报告。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人上海唯可生物科技有限公司,其通讯地址为:201100 上海市闵行区绿洲环路10号6幢402A室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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