南京邮电大学郭丽获国家专利权
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龙图腾网获悉南京邮电大学申请的专利基于平面距离的簇突变检测方法及装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119479796B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410792632.X,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权基于平面距离的簇突变检测方法及装置是由郭丽;赵鑫淼;金佳铭设计研发完成,并于2024-06-19向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于平面距离的簇突变检测方法及装置在说明书摘要公布了:本发明属于生物信息技术领域,具体涉及一种基于平面距离的簇突变检测方法及装置,本发明通过对样本数据分析得到聚类条件分界值、确定范围参数及突变参数、处理待测样本数据并合并簇得到聚类结果、对结果验证;本发明基于平面的距离识别进行聚类,采用完全不同的簇突变识别算法,相比于已有的多重滑动窗口,此算法拥有更高性能和更高的识别精度,且基于Java开发的算法只需提供API便可以方便地进行网页在线检测,不需要配置或下载任何配套环境或软件,极大地提高了便捷程度。
本发明授权基于平面距离的簇突变检测方法及装置在权利要求书中公布了:1.一种基于平面距离的簇突变检测方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤1:筛选样本数据并分析得到达成聚类条件的分界值,包括: 步骤1.1:获取已验证具有大量簇突变的样本数据;对所述样本数据进行筛选,保留突变类型为SNP的样本数据的基因列、染色体列和开始突变位点列数据作为输入检测数据; 步骤1.2:对步骤1.1中突变类型为SNP的样本数据转换得到雨林图,绘制k-distance曲线得到DBSCAN参数eps,进行DBSCAN聚类后计算轮廓系数检验聚类质量,并得到分界点; 其中,步骤1.2中所述的分界点为1000bp; 步骤2:定义突变位点能成簇的范围参数1,定义达成成簇条件所需的最少突变数量参数2; 其中,步骤2中所述的范围参数1及最少突变数量参数2通过几何原理以及雨林图显示原理得到; 所述范围参数1为1000√2; 所述最少突变数量参数2为1; 步骤3:处理待测样本的数据,依据关键节点与邻居节点集合合并簇,并得到聚类结果,包括: 步骤3.1:处理输入的待测样本的突变数据,将所述数据按序列分类,将序列上的每个SNP起始突变位置x,以及距离前一个SNP值y,记录到一个节点对象实例中,并将对应的基因名记录到当前节点实例; 步骤3.2:将所有节点实例映射为雨林图,并根据图中位置计算相邻最近节点; 步骤3.3:将在参数1范围内,满足参数2条件的节点存入节点类型集合,标记该节点类型集合为关键节点集合; 步骤3.4:遍历上述集合中的关键节点,计算在参数1范围内的所有节点并存入集合中,记为该集合为当前关键节点的邻居节点集合; 步骤3.5:若一关键节点的邻居节点集合,含有除其本身外的关键节点,则两者关键节点的邻居节点集合合并为一簇,以深度优先遍历上述结构得到聚类结果; 步骤4:验证聚类效果,并依据簇突变特征进行结果验证。
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