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中国科学院南京地理与湖泊研究所张又获国家专利权

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龙图腾网获悉中国科学院南京地理与湖泊研究所申请的专利一种基于高通量环境DNA测序的水生态损害评估鉴定方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119943136B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510033016.0,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权一种基于高通量环境DNA测序的水生态损害评估鉴定方法是由张又;邢鹏;陈辉辉;蔡永久;李宽意设计研发完成,并于2025-01-09向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于高通量环境DNA测序的水生态损害评估鉴定方法在说明书摘要公布了:本申请公开了一种基于高通量环境DNA测序的水生态损害评估鉴定方法,属于环境损害调查鉴定技术领域,包括整理目标区域的物种名录,搜索并下载物种序列信息,构建本地数据库,通过标本测序补全本地数据库信息;收集多个目标区域样点的底栖动物样本,从中选择测试样品,提取样品DNA,扩增并进行高通量测序,根据测序结果进行物种比对,预设多个reads数阈值,判断随机混合物种样本和定量配比物种混合样本中的物种是否被检测到,采用广义线性模型构建环境DNA测序与形态学映射关系模型,优化环境DNA测序与形态学映射关系模型,计算自然样本中特定物种的种群资源数量,进行水生态损害指示物种资源量的评估鉴定,提高基于环境DNA的水生态损害鉴定准确性和效率。

本发明授权一种基于高通量环境DNA测序的水生态损害评估鉴定方法在权利要求书中公布了:1.一种基于高通量环境DNA测序的水生态损害评估鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤1、通过文献检索的方式,整理并确定目标区域底栖动物的物种名录;同时,在目标区域进行底栖动物采样,收集多个样点的底栖动物样本; 步骤2、根据上一步骤中确定的物种名录,在公开数据库网站上搜索并下载对应的物种序列信息,构建本地数据库; 若是目标底栖物种在公开数据库中未检索到序列信息或者信息不全,且采样获得了该底栖动物样本,则分别对这些样本进行线粒体全基因组测序,并且将获得的序列信息上传保存至本地数据库; 步骤3、根据目标区域的底栖动物物种组成,从底栖动物样本中挑选底栖生物个体,分别形成多个测试样品:随机物种混合样本、定量配比物种混合样本和野外自然样本; 步骤4、针对所有测试样品,提取测试样品DNA,采用通用引物扩增目标片段DNA序列,对序列进行高通量测序,对测序结果分别选择本地数据库和公开数据库进行物种比对; 步骤5、根据随机物种混合样本的比对结果,把同一物种的不同OTU的reads数相加,预设多个reads数阈值,当相加的reads数大于该阈值时,认为该物种被检测到; 根据OTU相对reads数阈值分别分析测试样品的本地数据库和公开数据库相对于实际样本的物种映射率,当物种映射率到达预设数值时,认为该阈值有效; 步骤6、根据定量配比物种混合样本的比对结果,把同一物种的不同OTU的reads数相加,根据步骤5中预设的多个reads数阈值来判定物种是否存在; 采用广义线性模型构建每个物种的相对密度与每个目标样品中的相对reads数的相关关系,建立环境DNA测序与形态学映射关系模型; 步骤7、从不同引物条件中选择模型拟合效果最好的引物条件,对该引物多次重复步骤4和步骤6,优化环境DNA测序与形态学映射关系模型; 步骤8、根据野外自然样本的比对结果,结合优化后的环境DNA测序与形态学映射关系模型,计算出特定物种的种群资源数量信息,进行水生态损害指示物种资源量的评估鉴定。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国科学院南京地理与湖泊研究所,其通讯地址为:210008 江苏省南京市玄武区北京东路73号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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