中国科学院武汉病毒研究所郑振华获国家专利权
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龙图腾网获悉中国科学院武汉病毒研究所申请的专利结合参考序列和从头拼接的病毒基因组拼接方法和系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119943150B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411821976.5,技术领域涉及:G16B30/20;该发明授权结合参考序列和从头拼接的病毒基因组拼接方法和系统是由郑振华;张乃楼;徐闻;魏锦博;陈丹;苗元玖设计研发完成,并于2024-12-11向国家知识产权局提交的专利申请。
本结合参考序列和从头拼接的病毒基因组拼接方法和系统在说明书摘要公布了:本发明提供一种结合参考序列和从头拼接的病毒基因组拼接方法和系统,该方法包括:对病毒基因组序列的测序数据进行质量控制后,基于k‑mers策略去除测序数据中的宿主基因组序列;对测序数据从头拼接,生成病毒基因组初步组装序列;基于blastn工具对病毒基因组初步组装序列进行病毒分类注释,根据病毒分类注释从病毒库中选择高度相似的病毒基因组序列作为参考序列;根据参考序列和病毒基因组初步组装序列生成数据集,根据数据集中序列之间的相似度划分多个序列簇,生成共识序列;将去除宿主后的reads与共识序列进行比对,根据比对结果对共识序列进行调整,得到最终病毒基因组序列。本发明提高病毒基因组拼接的准确性,普适性强。
本发明授权结合参考序列和从头拼接的病毒基因组拼接方法和系统在权利要求书中公布了:1.一种结合参考序列和从头拼接的病毒基因组拼接方法,其特征在于,包括: 对病毒基因组序列的测序数据进行质量控制后,基于k-mers策略去除所述测序数据中的宿主基因组序列; 对去除宿主基因组序列后的所述测序数据进行从头拼接,生成病毒基因组初步组装序列; 基于blastn工具对所述病毒基因组初步组装序列进行病毒分类注释,根据所述病毒分类注释从病毒库中选择病毒基因组序列作为参考序列,所述参考序列与所述病毒基因组初步组装序列的相似度大于第一预设阈值; 根据所述参考序列和所述病毒基因组初步组装序列生成数据集,根据所述数据集中序列之间的相似度将所述数据集划分为多个序列簇,且每个序列簇内包含至少一个病毒基因组初步组装序列,根据每个序列簇中序列同一位置上占比最多的碱基生成共识序列; 将去除宿主基因组序列后的所述测序数据中的reads与所述共识序列进行比对,根据比对结果对所述共识序列进行调整,得到最终病毒基因组序列。
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