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齐鲁工业大学(山东省科学院);山东省计算中心(国家超级计算济南中心)郭猛获国家专利权

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龙图腾网获悉齐鲁工业大学(山东省科学院);山东省计算中心(国家超级计算济南中心)申请的专利一种面向异构众核处理器的轻量级MD模拟方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120373058B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510863697.3,技术领域涉及:G06F30/25;该发明授权一种面向异构众核处理器的轻量级MD模拟方法及系统是由郭猛;孟晓娟设计研发完成,并于2025-06-26向国家知识产权局提交的专利申请。

一种面向异构众核处理器的轻量级MD模拟方法及系统在说明书摘要公布了:本发明涉及MD模拟技术领域,本发明公开了一种面向异构众核处理器的轻量级MD模拟方法及系统,包括:基于坐标,主核将原子分配到不同的箱子中,并将所有原子的坐标映射为箱子编号,主核以每个箱子为单位,查找截断半径之内的箱子,将截断半径之内的箱子包含的所有原子,组成当前箱子的邻居原子集合,同一箱子内原子记录一个共享指针,指向其所在箱子的邻居原子集合;主核将箱子列表划分为可由若干从核并行处理的主块部分与余量,主块部分分发给从核,从核依据共享指针和邻居原子集合并行执行力计算,余量由主核执行力计算,从核计算完成,主核汇总从核力计算结果。实现了计算与存储的冗余削减,且打破了串行依赖。

本发明授权一种面向异构众核处理器的轻量级MD模拟方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种面向异构众核处理器的轻量级MD模拟方法,其特征在于,包括: 获取原子坐标; 基于坐标,主核将原子分配到不同的箱子中,并将所有原子的坐标映射为箱子编号,将所有原子的箱子编号存入箱子列表,若连续两个原子落入同一个箱子,则只存入一个箱子编号;主核以每个箱子为单位,查找截断半径之内的箱子,将截断半径之内的箱子包含的所有原子,组成当前箱子的邻居原子集合,同一箱子内原子记录一个共享指针,指向其所在箱子的邻居原子集合; 主核将箱子列表划分为可由若干从核并行处理的主块部分与余量,主块部分分发给从核,从核依据共享指针和邻居原子集合并行执行力计算,余量由主核执行力计算,从核计算完成,主核汇总从核力计算结果; 所述从核依据共享指针和邻居原子集合并行执行力计算的具体步骤包括:选取一个原子作为主控粒子,并依据共享指针确定其邻居原子集合在主存中的位置;遍历邻居原子集合,识别连续段;检查当前邻近原子索引是否与前一个索引连续,若连续并且不是最后一个原子,则继续扩展连续段;若不连续或者达到邻居原子集合末尾,则从主存中一次性预取一段连续原子的坐标信息,存储到从核的LDM后,执行力计算。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人齐鲁工业大学(山东省科学院);山东省计算中心(国家超级计算济南中心),其通讯地址为:250000 山东省济南市长清区大学路3501号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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