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深圳大学杜智华获国家专利权

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龙图腾网获悉深圳大学申请的专利细菌基因组的基因簇识别方法、装置、设备及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119811497B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-14发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411789998.8,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权细菌基因组的基因簇识别方法、装置、设备及存储介质是由杜智华;钟宁宇设计研发完成,并于2024-12-06向国家知识产权局提交的专利申请。

细菌基因组的基因簇识别方法、装置、设备及存储介质在说明书摘要公布了:本申请公开了一种细菌基因组的基因簇识别方法、装置、设备及存储介质,方法包括:利用预处理单元、ESM蛋白质语言单元、余弦近似度计算单元、归一化逐点互信息单元、术语频率‑逆文档频率单元、图卷积单元、BERT单元及softmax函数单元构建基因簇识别模型;将细菌基因组的BGC序列训练样本输入基因簇识别模型,利用交叉熵损失函数对基因簇识别模型进行训练,并利用Adam优化器对训练过程进行迭代优化;将待识别的细菌基因组的BGC序列数据集输入目标基因簇识别模型进行识别;对初步识别结果中的片段进行修正,得到最终识别结果;通过构建邻接矩阵并将其输入图卷积单元,提取BGC序列中Pfam结构域节点蕴含的全局特征,提高了模型的识别预测性能。

本发明授权细菌基因组的基因簇识别方法、装置、设备及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种细菌基因组的基因簇识别方法,特征在于,包括: 步骤100、获取预处理单元、ESM蛋白质语言单元、余弦近似度计算单元、归一化逐点互信息单元、术语频率-逆文档频率单元、图卷积单元及BERT单元,利用所述预处理单元、ESM蛋白质语言单元、余弦近似度计算单元、归一化逐点互信息单元、术语频率-逆文档频率单元、图卷积单元、BERT单元及softmax函数单元构建基因簇识别模型; 步骤200、将细菌基因组的BGC序列训练样本输入所述基因簇识别模型,利用交叉熵损失函数对所述基因簇识别模型进行训练,并利用Adam优化器对训练过程进行迭代优化,得到目标基因簇识别模型; 步骤300、将待识别的细菌基因组的BGC序列数据集输入所述目标基因簇识别模型进行识别,得到初步识别结果; 步骤400、对所述初步识别结果中的片段进行修正,得到最终识别结果; 其中,所述余弦近似度计算单元用于计算Pfam结构域节点的嵌入向量的相似度,所述归一化逐点互信息单元、术语频率-逆文档频率单元用于构建Pfam结构域节点邻接矩阵,所述图卷积单元用于提取Pfam结构域节点全局特征; 所述步骤200包括: 步骤210、利用所述预处理单元将所述BGC序列转换为Pfam序列; 步骤220、利用所述ESM蛋白质语言单元提取所述Pfam序列的嵌入向量; 步骤230、根据Pfam数据库并利用所述余弦近似度计算单元计算所述嵌入向量的相似度; 步骤240、根据所述相似度对BGC序列进行数据增强,得到增强BGC序列; 步骤250、根据输入的BGC序列,并利用所述归一化逐点互信息单元及术语频率-逆文档频率单元构建Pfam邻接矩阵; 步骤260、将所述Pfam邻接矩阵输入所述图卷积单元,提取Pfam全局特征; 步骤270、将所述Pfam全局特征输入所述BERT单元,利用所述BERT单元将所述Pfam全局特征与增强BGC序列中的局部特征进行特征融合,获取第一融合特征; 步骤280、将所述第一融合特征输入所述softmax函数单元,得到初步识别结果。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人深圳大学,其通讯地址为:518060 广东省深圳市南山区南海大道3688号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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