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武汉科技大学;湖州工业控制技术研究院盛玉霞获国家专利权

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龙图腾网获悉武汉科技大学;湖州工业控制技术研究院申请的专利一种基于多尺度超图的单细胞RNA测序数据聚类方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119889465B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-14发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411907819.6,技术领域涉及:G16B40/30;该发明授权一种基于多尺度超图的单细胞RNA测序数据聚类方法及系统是由盛玉霞;胡灿;柴利;杨春节设计研发完成,并于2024-12-24向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于多尺度超图的单细胞RNA测序数据聚类方法及系统在说明书摘要公布了:本发明提供了一种基于多尺度超图的单细胞RNA测序数据聚类方法及系统,通过由基因表达矩阵构造多尺度相似性矩阵;通过多尺度相似性矩阵生成细胞超图;进行细胞超图融合;对融合细胞超图的超图拉普拉斯矩阵进行SVD分解;提取前个最小特征值对应的特征向量,进行K‑means得到聚类结果,实现了提高对单细胞RNA测序数据的聚类效果的功能。本发明提出了一种新颖的超图生成方法,更好地捕捉了多个细胞之间的高阶相关性,使用多个尺度更准确的捕捉了细胞间的关联。与现有单细胞RNA测序数据聚类方法的比较表明,本发明提出了一种统一的聚类框架,该框架在多个尺度上全面学习细胞间的拓扑信息,并构建细胞超图进行聚类,能够获得较好的聚类结果。

本发明授权一种基于多尺度超图的单细胞RNA测序数据聚类方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于多尺度超图的单细胞RNA测序数据聚类方法,其特征在于:包括以下步骤: S1:通过多尺度相似性学习将基因表达矩阵转换为多尺度相似性矩阵;具体步骤为: S11:获取基因表达数据并归一化,然后表示为基因表达矩阵,矩阵的每一行表示一个细胞的基因表达向量,每一列表示同一个基因在不同细胞中的基因表达水平; S12:对基因表达数据构造三个维度相同的相似性矩阵并转换为多尺度相似性矩阵,对多尺度相似性矩阵进行对称化; S2:基于多尺度相似性矩阵生成细胞超图;具体步骤为: 通过多尺度相似性矩阵生成用三元组{顶点集,超边集,超边权重矩阵}描述的多尺度细胞超图,以及对应的关联矩阵; S3:根据细胞超图采用融合算法得到融合细胞超图;具体步骤为: 通过对细胞超图对应的关联矩阵求平均值以融合关联矩阵,将多尺度细胞超图融合构造为融合细胞超图; S4:通过融合细胞超图计算超图拉普拉斯矩阵,并进行SVD分解得到特征向量; S5:提取前K个最小特征值对应的特征向量,进行K-means得到聚类结果。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人武汉科技大学;湖州工业控制技术研究院,其通讯地址为:430081 湖北省武汉市青山区和平大道947号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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