深圳北理莫斯科大学柴可夫斯基德米特里获国家专利权
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龙图腾网获悉深圳北理莫斯科大学申请的专利一种基于核酸序列距离矩阵的系统发育树构建方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119721195B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-17发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510230572.7,技术领域涉及:G06N5/01;该发明授权一种基于核酸序列距离矩阵的系统发育树构建方法及系统是由柴可夫斯基德米特里设计研发完成,并于2025-02-28向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于核酸序列距离矩阵的系统发育树构建方法及系统在说明书摘要公布了:本发明提供了一种基于核酸序列距离矩阵的系统发育树构建方法及系统,包括步骤:获取并处理原始核酸序列数据,得到标准核酸序列数据;从所述标准核酸序列数据中提取若干核酸序列,获取若干所述核酸序列中任意两条核酸序列之间的全局比对距离,生成所述标准核酸序列数据的初始距离矩阵;获取所述初始距离矩阵的超度量偏差和函数;对所述初始距离矩阵进行迭代优化,获取超度量偏差和函数最小的优化距离矩阵;以及基于所述优化距离矩阵,构建系统发育树。通过混合优化技术来得到有效的核酸序列距离矩阵,从而在初始数据不完整或规模过大的情况下,保证能够精确地构建系统发育树。
本发明授权一种基于核酸序列距离矩阵的系统发育树构建方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于核酸序列距离矩阵的系统发育树构建方法,其特征在于,包括步骤: 获取并处理原始核酸序列数据,得到标准核酸序列数据; 从所述标准核酸序列数据中提取若干核酸序列,获取若干所述核酸序列中任意两条核酸序列之间的全局比对距离,生成所述标准核酸序列数据的初始距离矩阵; 获取所述初始距离矩阵的超度量偏差和函数; 对所述初始距离矩阵进行迭代优化,获取超度量偏差和函数最小的优化距离矩阵; 基于所述优化距离矩阵,构建系统发育树; 其中,获取所述初始距离矩阵的超度量偏差和函数,具体包括: 从所述标准核酸序列数据中提取三条核酸序列; 基于所述初始距离矩阵,获取所述三条核酸序列之间的三组初始距离; 基于所述三组初始距离与三角不等式的关系,获取所述三条核酸序列的超度量偏差; 重复以上步骤,获取所述标准核酸序列数据中任意三条核酸序列的超度量偏差并进行求和,获取所述超度量偏差和函数,所述超度量偏差和函数为: , 其中D对应初始距离矩阵,对应所述标准核酸序列数据中任意三条核酸序列,为超度量偏差,为所述标准核酸序列数据中核酸序列的总数。
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