山东大学王峻获国家专利权
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龙图腾网获悉山东大学申请的专利基于异质生物分子网络的SNP交互作用检测系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115240765B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210867452.4,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权基于异质生物分子网络的SNP交互作用检测系统是由王峻;王昕;余国先;郭茂祖;何伟设计研发完成,并于2022-07-21向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于异质生物分子网络的SNP交互作用检测系统在说明书摘要公布了:本公开提供了一种基于异质生物分子网络的SNP交互作用检测系统,所述方案包括:获取患病个体与不患病个体的SNP序列,并对数据进行预处理;根据样本的SNP序列和样本的患病情况,构建统计学SNP相关网络;基于已知的SNP与生物分子的相关关系,以及生物分子与疾病的相关关系,构建三阶SNP相关网络;基于已知的SNP与基因的相关关系,以及基因之间的功能上的相关关系,构建二阶SNP相关网络;基于所述统计学SNP相关网络、三阶SNP相关网络及二阶SNP相关网络,构建用于描述SNP相关关系的复合网络;基于所述复合网络对SNP序列进行聚类;从每个聚簇中检测与疾病相关的高维SNP组合。
本发明授权基于异质生物分子网络的SNP交互作用检测系统在权利要求书中公布了:1.一种基于异质生物分子网络的SNP交互作用检测系统,其特征在在于,包括: 数据预获取模块,其被配置为:获取患病个体与不患病个体的SNP序列,并对数据进行预处理; 统计学网络构建模块,其被配置为:根据样本的SNP序列和样本的患病情况,构建统计学SNP相关网络; 三阶SNP相关网络构建模块,其被配置为:基于已知的SNP与生物分子的相关关系,以及生物分子与疾病的相关关系,构建三阶SNP相关网络,具体步骤包括: 根据已验证的SNP和基因,miRNA,lncRNA的关联关系,构建描述该关联关系的矩阵; 根据已验证的疾病和基因,miRNA,lncRNA的关联关系,构建描述该关联关系的矩阵; 基于矩阵中隐含的SNP到SNP之间的路径,实现SNP相关网络的构建; 二阶SNP相关网络构建模块,其被配置为:基于已知的SNP与基因的相关关系,以及基因之间的功能上的相关关系,仅保留每个SNP与其最相似的p个SNP作为其邻居,构建二阶SNP相关网络,具体为: 确定SNP、基因及基因本体之间的映射关系; 计算基因本体之间的相似度; 将其转化为SNP之间的相似度,实现SNP相关网络的构建; 复合网络生成模块,其被配置为:基于所述统计学SNP相关网络、三阶SNP相关网络及二阶SNP相关网络,构建用于描述SNP相关关系的复合网络; 由三种SNP相关网络构建一个复合的网络,描述最终的SNP相关关系;具体包括: 复合网络Nscn定义为: 其中w11,w12,w13,w21均为参数,通过参数分析确定其具体值; 聚类模块,其被配置为:基于所述复合网络对SNP序列进行聚类; 交互作用检测模块,其被配置为:从每个聚簇中检测与疾病相关的高维SNP组合。
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