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上海鹿明生物科技有限公司陆嘉伟获国家专利权

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龙图腾网获悉上海鹿明生物科技有限公司申请的专利一种空间转录组与空间代谢组空间信息匹配方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115798587B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211282284.9,技术领域涉及:G16B25/10;该发明授权一种空间转录组与空间代谢组空间信息匹配方法及系统是由陆嘉伟;王春云;顾婕;舒烈波;付艳蕾设计研发完成,并于2022-10-19向国家知识产权局提交的专利申请。

一种空间转录组与空间代谢组空间信息匹配方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种空间转录组与空间代谢组空间信息匹配方法通过将空间转录组与空间代谢组的空间信息标识统一,并将空间代谢组的空间坐标体系匹配转换成空间转录组的空间坐标,实现空间转录组与空间代谢组的空间信息匹配。本发明还公开了一种实现上述空间信息匹配方法的系统,包括空间信息获取模块、空间坐标统一模块、空间参数运算模块、空间信息转化模块,实现空间转录组与空间代谢组空间信息的匹配。

本发明授权一种空间转录组与空间代谢组空间信息匹配方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种空间转录组与空间代谢组空间信息匹配方法,其特征在于,所述空间信息匹配方法通过将空间转录组与空间代谢组的空间信息标识统一,并将空间代谢组的空间坐标体系匹配转换成空间转录组的空间坐标,实现空间转录组与空间代谢组的空间信息匹配,包括如下步骤: 步骤1、在空间转录组的样本检测范围内选择均匀分布的6个及以上的点spot作为标识点位,获取标识点spot对应的条形码barcode信息并在对应HE染色图上标识选择的点spot; 步骤2、使用步骤一中已经标识点位的HE染色图与空间代谢组成像图进行配准,获取配准后标识点位在空间代谢组上的对应像素点的空间坐标位置信息; 步骤3、将空间转录组的条形码barcode空间信息和空间代谢组的空间信息转化为统一的空间信息标识; 步骤4、计算空间转录组中不同标识点间距离;计算空间代谢组不同标识点间距离;并将空间转录组与空间代谢组对应的标识点间距离求缩放比; 步骤4中,为了进行空间转录组和空间代谢组中的标识点对应准确性评判以及校正实验仪器误差导致标志点位置差异,进行所述缩放比的计算; 所述缩放比的计算公式如下: Ratio=sqrtUTXa-UTXb2+UTYa-UTYb2sqrtUMXa-UMXb2+UMYa-UMYb2 其中,UTXa、UTYa、UTXb、UTYb分别为空间转录组中标志点a和b经统一空间坐标后的X,Y坐标值;UMXa、UMYa、UMXb、UMYb分别为空间代谢组中标志点a和b经统一空间坐标后的X,Y坐标值;Ratio为空间转录组中标志点a和b的距离与空间代谢组中标志点a和b的距离的缩放比; 获得各标志点两两之间的缩放比后,还需要进行对缩放比数据的筛选,所述筛选操作包括:剔除缩放比结果大于1.1及小于0.91的数据,同时保证剩余缩放比数据的数量≥4,对剩余的缩放比数据求均值获得用于空间代谢组转换的最终缩放比;若剩余缩放比数据的数量<4,则回到步骤1重新进行; 步骤5、通过空间转录组与空间代谢组中各标识点位两两连线的旋转角度判断空间转录组与空间代谢组样本检测过程中是否翻转并计算空间转录组与空间代谢组检测样本之间的最终旋转角度; 步骤6、通过最终旋转角度、最终缩放比、空间转录组中心标识点坐标三个参数使用转换空间标识方法将空间代谢组空间坐标转换,使转化后的空间代谢组坐标与空间转录组坐标匹配; 步骤6中,所述空间转录组中心标识点是指空间转录组检测芯片中心点位置; 所述转换空间标识方法是指通过空间坐标转换将空间代谢组中每个像素点的空间位置转换成空间转录组中的对应坐标,步骤4和步骤5中获得的最终缩放比和最终旋转角度同样满足下述计算公式: Ratio’=sqrtUMX’-UTXo2+UTY’-UTYo2sqrtUMX-UMXo2+UMY-UMYo2; Angle’=arctanUMY-UMYoUMX-UMXo-arctanUMY’-UTYoUMX’-UTXo; 其中,Ratio’为最终缩放比;Angle’为最终旋转角度;UTXo及UTYo为空间转录组检测芯片中心点位置统一坐标体系后的空间信息;UMXo及UMYo为空间转录组检测芯片中心点位置在空间代谢组对应位置的统一坐标体系后的空间信息;UMX、UMY为空间代谢组统一空间坐标后的X,Y坐标值;UMX’及UMY’为空间代谢组匹配空间转录组后的X,Y坐标值。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人上海鹿明生物科技有限公司,其通讯地址为:201112 上海市闵行区浦江镇联航路浦江智谷1188号25幢5楼;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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