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大连大学王宾获国家专利权

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龙图腾网获悉大连大学申请的专利一种动态更新哈希索引的DNA存储聚类方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116486923B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310549371.4,技术领域涉及:G16B40/30;该发明授权一种动态更新哈希索引的DNA存储聚类方法是由王宾;王鹏浩;曹犇;郑燕芬;周士华;吕卉;张强;魏小鹏设计研发完成,并于2023-05-16向国家知识产权局提交的专利申请。

一种动态更新哈希索引的DNA存储聚类方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种动态更新哈希索引的DNA存储聚类方法,包括在初始序列三个位置选取DNA片段,并将这三个DNA片段通过计算哈希码方式转化为对应的哈希值,再映射到三个哈希表中。在后续待聚类的序列中,同样在这三个位置选取DNA片段,分别计算哈希码并进行冲突检测,进而判断是否属于同一个簇;当簇中序列数量达到5条时,对核心索引集进行一次更新,以避免错误的索引导致序列错误分流。本发明动态更新哈希索引的DNA存储聚类方法,因为索引的及时更新使得簇内序列的相似性得到显著提高,避免错误的索引导致的序列被错误分流。这种方法的优点在于提高了聚类的准确性和可靠性,为大规模的DNA数据存储和提供了良好的支持。

本发明授权一种动态更新哈希索引的DNA存储聚类方法在权利要求书中公布了:1.一种动态更新哈希索引的DNA存储聚类方法,其特征在于,包括: 步骤1:建立前哈希表、中哈希表和后哈希表,每个表均包括核心索引值Baseindex和核心键值Basevalue; 步骤2:构建初始核心索引,从特定三个位置选出DNA片段,并得到每个DNA片段对应的哈希码; 步骤3:通过哈希映射方式将三个DNA片段的哈希码分别映射到前哈希表、中哈希表和后哈希表中; 步骤4:在哈希映射时,将三个位置的哈希码value值作为核心键值Basevalue,同时将该序列的index一并写入对应哈希表中作为核心索引值Baseindex; 步骤5:对于后续待聚类的序列,仍然取特定三个位置上的DNA片段,并得到每个位置的哈希码value值; 步骤6:通过冲突检测的方式查找是否具有相同核心键值Basevalue的序列,进而判断是否属于同一个簇; 步骤7:将待聚类序列三个位置的哈希码value值和Index分别映射到前哈希表、中哈希表和后哈希表中,作为一个新簇的核心键值Basevalue和核心索引值Baseindex; 步骤8:当每个簇内的序列数量达到N条时,对该簇中的所有序列在三个位置上进行投票,以更新该簇在前哈希表、中哈希表和后哈希表中的Basevalue值,而Baseindex值不变; 步骤9:每个待聚类序列都归属于相应的簇之后,再将簇内序列数量少于N-2的簇进行归类;如果没有同簇的,直接丢弃; 步骤10:得到聚类后簇中的每条序列; 所述哈希码的获取方式为: x0an-1+x1an-2+x2an-3+...+xn-2a+xn-1a0 其中,x为碱基赋值,A赋值1,T赋值2,G赋值3,C赋值4,n为DNA片段碱基长度,a等于2; 通过冲突检测的方式查找是否具有相同核心键值的序列,具体为: 如果待聚类的序列在两个位置上的哈希码value值与对应的两个哈希表中的核心键值Basevalue冲突且核心索引值Baseindex一致,那么说明待聚类序列和核心序列属于同一个簇;如果有一个位置上的哈希码value值与核心键值Basevalue发生冲突,或者均不存在哈希冲突,那么说明待聚类序列和核心序列不属于同一个簇。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人大连大学,其通讯地址为:116622 辽宁省大连市经济技术开发区学府大街10号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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