北京艾格瑞吉数据科技有限公司陶家军获国家专利权
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龙图腾网获悉北京艾格瑞吉数据科技有限公司申请的专利一种通过组合图形直观展示生物个体间遗传差异及组合图形生成方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119359841B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411450695.3,技术领域涉及:G06T11/00;该发明授权一种通过组合图形直观展示生物个体间遗传差异及组合图形生成方法是由陶家军;王嘉力;杨峥设计研发完成,并于2024-10-17向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种通过组合图形直观展示生物个体间遗传差异及组合图形生成方法在说明书摘要公布了:本发明涉及展示遗传差异的图形生成技术领域,具体地说,涉及一种通过组合图形直观展示生物个体间遗传差异及组合图形生成方法。包括以下步骤:S1、从DNA样本中选择单核苷酸多态性SNP位点,并使用测序方法来获得个体的SNP信息;S2、设计编码规则,并为单核苷酸多态性SNP的基因型分配不同的颜色;S3、根据编码规则,创建可视化的二维图形;S4、验证创建的二维图形是否能准确反映遗传差异。本发明设计通过为不同基因型分配特定颜色,并将这些信息整合进二维图形,使得复杂的遗传信息变得可视化。这不仅有助于研究人员快速识别个体间的遗传差异,而且也便于非专业人士理解遗传学的基本概念。
本发明授权一种通过组合图形直观展示生物个体间遗传差异及组合图形生成方法在权利要求书中公布了:1.一种通过组合图形直观展示生物个体间遗传差异及组合图形生成方法,其特征在于:包括以下步骤: S1、从DNA样本中选择单核苷酸多态性SNP位点,并使用高通量测序方法来获得个体的SNP信息; S2、设计编码规则,并为单核苷酸多态性SNP的基因型分配不同的颜色; 所述S2中,设计编码规则,并为单核苷酸多态性SNP的基因型分配不同的颜色,包括以下步骤: S2.1、选择步骤S1中得到的高通量测序结果中变异频率较高的SNP位点; S2.2、将选择的SNP位点按照它们在染色体上的实际位置进行排序,并将每个SNP位点的位置信息记录下来; S2.3、将纯合子显性基因型标记为白色,杂合子基因型标记为灰色,纯合子隐性基因型标记为黑色; S3、根据编码规则,创建可视化的二维图形; S4、验证创建的二维图形是否能准确反映遗传差异; 所述S3中,根据编码规则,创建可视化的二维图形,包括以下步骤: S3.1、创建空白的二维网格; S3.2、按照染色体的位置顺序,将每一个SNP位点映射到网格中的一个单元格内; S3.3、根据步骤S2.3中定义的颜色编码规则,为每一个单元格内的SNP位点分配相应的颜色; S3.4、使用分配的颜色填充网格中的每个单元格,通过局部异常因子LOF算法识二维别图形中的异常的SNP位点,并用不同颜色将异常的SNP位点标出来; S3.5、使用图形编辑软件生成最终的二维图形; 所述S3.4中,通过局部异常因子LOF算法识二维别图形中的异常的SNP位点,并用不同颜色将异常的SNP位点标出来,包括以下步骤: S3.41、对SNP位点的数据进行归一化处理; S3.42、使用欧氏距离计算每个SNP位点与其他所有SNP位点之间的距离; S3.43、对于每一个SNP位点,找到其k个最近邻点; S3.44、计算每个SNP位点的局部可达性密度,并计算每个SNP位点的局部密度; S3.45、对于每个SNP位点,计算其LOF值; S3.46、根据LOF值判断异常的SNP位点,并用不同的颜色标识出LOF值高于阈值K的异常的SNP位点。
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